More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2874 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  94.44 
 
 
378 aa  670    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
378 aa  763    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  77.07 
 
 
374 aa  593  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  75.4 
 
 
378 aa  586  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  76.6 
 
 
374 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  76.6 
 
 
374 aa  568  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  76.88 
 
 
373 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  76.46 
 
 
374 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  72.46 
 
 
373 aa  555  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.74 
 
 
374 aa  553  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  72.97 
 
 
372 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  69.6 
 
 
376 aa  546  1e-154  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  71.85 
 
 
372 aa  545  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  74.87 
 
 
381 aa  528  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.27 
 
 
370 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  69.09 
 
 
370 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71 
 
 
368 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  69.73 
 
 
372 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  67.84 
 
 
369 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  71.7 
 
 
369 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.59 
 
 
369 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  60.38 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  58.49 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  57.8 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.53 
 
 
376 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  54.33 
 
 
387 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  56.1 
 
 
383 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.84 
 
 
377 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.91 
 
 
377 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  54.33 
 
 
387 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  51.19 
 
 
385 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.49 
 
 
378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  54.96 
 
 
375 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.18 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  53.79 
 
 
388 aa  355  6.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  56.18 
 
 
352 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.31 
 
 
387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.96 
 
 
375 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  45.99 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.77 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.3 
 
 
378 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.3 
 
 
378 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.77 
 
 
387 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.76 
 
 
378 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.87 
 
 
381 aa  335  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  46.87 
 
 
381 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  45.82 
 
 
387 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.05 
 
 
381 aa  333  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.46 
 
 
382 aa  329  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.26 
 
 
387 aa  329  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.77 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.77 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.73 
 
 
391 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.31 
 
 
388 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.78 
 
 
387 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.28 
 
 
387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.88 
 
 
384 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  47.99 
 
 
387 aa  319  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.51 
 
 
387 aa  319  6e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.28 
 
 
387 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.31 
 
 
387 aa  315  8e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  52.31 
 
 
219 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  44.88 
 
 
124 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  25.78 
 
 
380 aa  106  6e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  29.19 
 
 
357 aa  105  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  28.21 
 
 
404 aa  99.4  9e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3266  GMP reductase  31.96 
 
 
368 aa  96.3  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.2 
 
 
483 aa  94.7  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.29 
 
 
488 aa  93.6  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  25.33 
 
 
373 aa  93.6  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.37 
 
 
482 aa  93.2  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.37 
 
 
482 aa  93.2  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.8 
 
 
380 aa  92.8  8e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.24 
 
 
508 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.81 
 
 
485 aa  91.3  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1127  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.03 
 
 
382 aa  90.5  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000270815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.33 
 
 
488 aa  90.1  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.82 
 
 
490 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.38 
 
 
490 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.23 
 
 
486 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30 
 
 
485 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.23 
 
 
485 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.13 
 
 
483 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.24 
 
 
490 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.08 
 
 
487 aa  88.2  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  27.66 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.69 
 
 
493 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.87 
 
 
482 aa  87.8  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3045  GMP reductase  30.24 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.15 
 
 
486 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.92 
 
 
483 aa  86.7  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.23 
 
 
486 aa  86.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.6 
 
 
486 aa  86.3  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.59 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.83 
 
 
486 aa  85.5  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  29.96 
 
 
484 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.48 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.67 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.44 
 
 
485 aa  84.3  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.218435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.49 
 
 
488 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>