More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3640 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
368 aa  741    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  75.96 
 
 
374 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  75.75 
 
 
372 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  75.75 
 
 
372 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  76.02 
 
 
372 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.21 
 
 
370 aa  560  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  76.23 
 
 
374 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  76.57 
 
 
373 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  72.01 
 
 
370 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  72.21 
 
 
373 aa  551  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  74.04 
 
 
374 aa  548  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  72.75 
 
 
369 aa  549  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  74.59 
 
 
374 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.03 
 
 
374 aa  525  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  68.01 
 
 
378 aa  522  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  74.86 
 
 
381 aa  524  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  67.58 
 
 
376 aa  520  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.66 
 
 
369 aa  508  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71 
 
 
378 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  70.77 
 
 
369 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.92 
 
 
378 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.41 
 
 
376 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.13 
 
 
387 aa  421  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  57.33 
 
 
387 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  60 
 
 
396 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.84 
 
 
386 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  58.04 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  57.33 
 
 
387 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.3 
 
 
377 aa  381  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  60.4 
 
 
352 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.56 
 
 
377 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  56.02 
 
 
388 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  51.58 
 
 
385 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.65 
 
 
376 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  54.69 
 
 
375 aa  362  6e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.09 
 
 
387 aa  360  3e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.23 
 
 
378 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.99 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.27 
 
 
387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.99 
 
 
387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.27 
 
 
387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.45 
 
 
433 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.41 
 
 
384 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.47 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.91 
 
 
387 aa  352  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  48.19 
 
 
381 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.19 
 
 
391 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.63 
 
 
381 aa  348  6e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.37 
 
 
388 aa  348  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.23 
 
 
387 aa  348  7e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.99 
 
 
387 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  48.63 
 
 
387 aa  343  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.17 
 
 
387 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.36 
 
 
387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.26 
 
 
387 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.18 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.62 
 
 
378 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.42 
 
 
375 aa  326  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.82 
 
 
378 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.82 
 
 
378 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.7 
 
 
382 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  55.44 
 
 
219 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  44.92 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  29.68 
 
 
404 aa  111  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30 
 
 
485 aa  102  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  27.01 
 
 
373 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.99 
 
 
380 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.33 
 
 
483 aa  100  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  27.98 
 
 
483 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  28.52 
 
 
357 aa  100  6e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  26.09 
 
 
380 aa  99.8  7e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.17 
 
 
481 aa  99.8  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1127  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.44 
 
 
382 aa  99.4  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000270815  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.08 
 
 
482 aa  98.6  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  31.85 
 
 
384 aa  99  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.61 
 
 
486 aa  97.8  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.27 
 
 
482 aa  97.1  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  43.62 
 
 
487 aa  97.1  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.62 
 
 
486 aa  97.1  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.27 
 
 
482 aa  96.7  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.39 
 
 
482 aa  94.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.5 
 
 
483 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.98 
 
 
490 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.29 
 
 
489 aa  92.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.64 
 
 
483 aa  92  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.27 
 
 
485 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.42 
 
 
488 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.4 
 
 
508 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.51 
 
 
488 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.91 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.88 
 
 
490 aa  90.9  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  28.53 
 
 
484 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.25 
 
 
490 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.77 
 
 
496 aa  90.5  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.11 
 
 
486 aa  89.7  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.25 
 
 
497 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.93 
 
 
556 aa  89.7  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3045  GMP reductase  32.65 
 
 
374 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35 
 
 
486 aa  89  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.5 
 
 
487 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>