More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4446 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  100 
 
 
383 aa  754    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  63.54 
 
 
387 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  64.06 
 
 
387 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  60.27 
 
 
370 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.95 
 
 
370 aa  431  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  61.44 
 
 
377 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  59.95 
 
 
372 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  59.67 
 
 
372 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.63 
 
 
377 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.72 
 
 
374 aa  412  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  63.46 
 
 
352 aa  408  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  62.53 
 
 
375 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  55.53 
 
 
378 aa  401  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  55.56 
 
 
376 aa  404  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  58.27 
 
 
372 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  55.28 
 
 
373 aa  401  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  58.04 
 
 
368 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  55.01 
 
 
374 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  55.04 
 
 
369 aa  391  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  58.78 
 
 
378 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  58.31 
 
 
373 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  56.91 
 
 
374 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.4 
 
 
369 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  55.86 
 
 
374 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.76 
 
 
374 aa  378  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  57.07 
 
 
385 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  58.18 
 
 
388 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  60.7 
 
 
375 aa  375  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.57 
 
 
378 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.1 
 
 
378 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.31 
 
 
378 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.31 
 
 
378 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.76 
 
 
376 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.1 
 
 
378 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.64 
 
 
381 aa  360  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  57.89 
 
 
382 aa  358  9e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  56.28 
 
 
369 aa  355  6.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.5 
 
 
387 aa  349  6e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.86 
 
 
376 aa  326  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.41 
 
 
386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  51.22 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.11 
 
 
433 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.78 
 
 
387 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.02 
 
 
387 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.02 
 
 
387 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.57 
 
 
387 aa  285  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.57 
 
 
387 aa  282  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.57 
 
 
387 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  41.73 
 
 
388 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  41.19 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  42.35 
 
 
384 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.11 
 
 
381 aa  267  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.11 
 
 
381 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  41.8 
 
 
387 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  41.8 
 
 
387 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  40.11 
 
 
381 aa  266  5e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  41.03 
 
 
387 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.95 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  40.22 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.67 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.21 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  44.85 
 
 
219 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  38.66 
 
 
124 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.75 
 
 
485 aa  87  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.81 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  24.93 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.05 
 
 
483 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.12 
 
 
481 aa  79  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  27.15 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  23.56 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.8 
 
 
482 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.51 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.88 
 
 
490 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.67 
 
 
485 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.33 
 
 
486 aa  77.4  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  24.03 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.89 
 
 
483 aa  76.3  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.24 
 
 
482 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.24 
 
 
482 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.51 
 
 
482 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.54 
 
 
483 aa  73.9  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.41 
 
 
488 aa  73.6  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2950  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.87 
 
 
488 aa  73.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645163  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.94 
 
 
483 aa  73.6  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.38 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07600  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.74 
 
 
498 aa  73.2  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.194742 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.38 
 
 
490 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.73 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.08 
 
 
503 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.16 
 
 
486 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.42 
 
 
508 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.51 
 
 
489 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.3 
 
 
485 aa  71.2  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.218435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.13 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.95 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.67 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.68 
 
 
489 aa  70.9  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.5 
 
 
488 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.75 
 
 
516 aa  70.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>