More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1073 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  93.28 
 
 
387 aa  744    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  788    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  85.53 
 
 
433 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  95.09 
 
 
387 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.61 
 
 
387 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.61 
 
 
387 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.87 
 
 
387 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71.58 
 
 
388 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.96 
 
 
387 aa  570  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.77 
 
 
387 aa  565  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.51 
 
 
387 aa  560  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.99 
 
 
387 aa  551  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.41 
 
 
384 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  67.18 
 
 
387 aa  538  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.18 
 
 
387 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.18 
 
 
387 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.12 
 
 
391 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.94 
 
 
381 aa  401  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.4 
 
 
381 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  50.94 
 
 
381 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.94 
 
 
386 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  49.74 
 
 
396 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  45.38 
 
 
372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.48 
 
 
387 aa  352  5e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  44.57 
 
 
372 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.44 
 
 
370 aa  346  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  71.76 
 
 
219 aa  343  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  43.75 
 
 
370 aa  338  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  45.11 
 
 
374 aa  335  7.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  45.55 
 
 
372 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  45.36 
 
 
369 aa  331  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.17 
 
 
368 aa  325  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  43.6 
 
 
369 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.29 
 
 
373 aa  317  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  44.02 
 
 
374 aa  315  9e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  42.12 
 
 
374 aa  314  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  44.57 
 
 
374 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.02 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  40.54 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  41.3 
 
 
376 aa  305  7e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  39.14 
 
 
378 aa  302  7.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.84 
 
 
381 aa  293  5e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  43.29 
 
 
369 aa  291  9e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.28 
 
 
378 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  42.47 
 
 
378 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  39.02 
 
 
383 aa  272  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  38.74 
 
 
387 aa  270  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.34 
 
 
377 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.63 
 
 
377 aa  256  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  38.48 
 
 
387 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  36.8 
 
 
385 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.83 
 
 
376 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  36.02 
 
 
375 aa  239  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.92 
 
 
378 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  38.24 
 
 
352 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  34.99 
 
 
388 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.66 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.66 
 
 
378 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.46 
 
 
375 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.37 
 
 
382 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  59.66 
 
 
124 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.97 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.01 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.01 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.35 
 
 
508 aa  116  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.84 
 
 
516 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.86 
 
 
498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.6 
 
 
485 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  30.11 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.49 
 
 
482 aa  113  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.27 
 
 
490 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  29.13 
 
 
357 aa  112  9e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.65 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.09 
 
 
488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.86 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.14 
 
 
488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.08 
 
 
486 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.5 
 
 
488 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.59 
 
 
485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.59 
 
 
488 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.29 
 
 
380 aa  109  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.56 
 
 
487 aa  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3266  GMP reductase  30.34 
 
 
368 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.83 
 
 
488 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1082  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.19 
 
 
514 aa  109  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.62 
 
 
487 aa  109  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.04 
 
 
491 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1716  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.62 
 
 
489 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.626692  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1201  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.15 
 
 
485 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.795344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.95 
 
 
489 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.26 
 
 
487 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.92 
 
 
489 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1078  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.68 
 
 
485 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.472537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.67 
 
 
487 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.85 
 
 
482 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.27 
 
 
482 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.79 
 
 
498 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>