More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0815 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
386 aa  782    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  74.29 
 
 
396 aa  542  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.13 
 
 
387 aa  479  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  64.03 
 
 
372 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.49 
 
 
370 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  61.85 
 
 
372 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  60.66 
 
 
372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  59.4 
 
 
370 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.3 
 
 
387 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  58.7 
 
 
374 aa  442  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.85 
 
 
387 aa  440  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.75 
 
 
387 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.52 
 
 
387 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.85 
 
 
387 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.75 
 
 
387 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.85 
 
 
387 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  60.49 
 
 
374 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  58.86 
 
 
374 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.2 
 
 
433 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  56.07 
 
 
387 aa  428  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.23 
 
 
387 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.73 
 
 
368 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.94 
 
 
387 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.94 
 
 
387 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.14 
 
 
384 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  57.49 
 
 
369 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  57.53 
 
 
369 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  55.71 
 
 
373 aa  423  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.07 
 
 
387 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  57.22 
 
 
374 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.35 
 
 
381 aa  414  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  57.77 
 
 
373 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  55.43 
 
 
376 aa  415  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.82 
 
 
381 aa  411  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.01 
 
 
388 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.07 
 
 
387 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  53.35 
 
 
381 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.62 
 
 
374 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.78 
 
 
391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  53.37 
 
 
378 aa  401  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  57.77 
 
 
381 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  57.8 
 
 
378 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  57.26 
 
 
378 aa  388  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.99 
 
 
376 aa  371  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  55.49 
 
 
369 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  52.39 
 
 
387 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  52.66 
 
 
387 aa  338  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  50.41 
 
 
383 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.51 
 
 
376 aa  334  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.6 
 
 
377 aa  328  9e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.91 
 
 
377 aa  326  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  53.98 
 
 
352 aa  319  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  48.83 
 
 
388 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  48.39 
 
 
375 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  44.85 
 
 
385 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.67 
 
 
378 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.58 
 
 
378 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  63.03 
 
 
219 aa  272  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.12 
 
 
375 aa  272  7e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.77 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.77 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.01 
 
 
382 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  52.94 
 
 
124 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1127  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.72 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000270815  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  28.05 
 
 
404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.4 
 
 
483 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.25 
 
 
485 aa  117  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.05 
 
 
482 aa  116  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.15 
 
 
488 aa  116  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.05 
 
 
482 aa  116  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.8 
 
 
487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.29 
 
 
508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  29.02 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  29.68 
 
 
357 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.14 
 
 
486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2950  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645163  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.6 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.41 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.03 
 
 
498 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0737a  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.99 
 
 
487 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.62 
 
 
482 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.82 
 
 
499 aa  111  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.45 
 
 
380 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  28.91 
 
 
373 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.7 
 
 
487 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.83 
 
 
489 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.33 
 
 
488 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.51 
 
 
489 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.03 
 
 
498 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.19 
 
 
488 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  30.1 
 
 
384 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1913  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.84 
 
 
486 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.55 
 
 
488 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3124  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.29 
 
 
490 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119862  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.34 
 
 
486 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.84 
 
 
481 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.6 
 
 
490 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.25 
 
 
488 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
490 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01076  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
487 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>