More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0459 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  779    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  72.66 
 
 
396 aa  530  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.13 
 
 
386 aa  493  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  65.58 
 
 
372 aa  480  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.49 
 
 
369 aa  480  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.96 
 
 
370 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  63.49 
 
 
374 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  63.69 
 
 
372 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  63.49 
 
 
374 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  62.5 
 
 
369 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  61.25 
 
 
370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  62.6 
 
 
372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.13 
 
 
368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  61.85 
 
 
374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  58.04 
 
 
374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.6 
 
 
373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  61.41 
 
 
374 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  57.45 
 
 
373 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.12 
 
 
381 aa  438  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  57.68 
 
 
378 aa  436  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  56.22 
 
 
376 aa  427  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.4 
 
 
387 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.52 
 
 
433 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  60.38 
 
 
378 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50 
 
 
387 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.62 
 
 
381 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.55 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.57 
 
 
378 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.48 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.55 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  51.89 
 
 
381 aa  398  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.26 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.35 
 
 
381 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.33 
 
 
387 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.33 
 
 
387 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  53.89 
 
 
387 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53 
 
 
384 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.04 
 
 
387 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.78 
 
 
387 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.59 
 
 
387 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.76 
 
 
376 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.85 
 
 
391 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  55.05 
 
 
387 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  57.38 
 
 
369 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.29 
 
 
388 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.81 
 
 
387 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  54.5 
 
 
383 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.49 
 
 
377 aa  371  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.18 
 
 
376 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  54.79 
 
 
387 aa  363  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.9 
 
 
377 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  49.08 
 
 
385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  50.94 
 
 
375 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  49.61 
 
 
388 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  53.69 
 
 
352 aa  319  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.07 
 
 
378 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.81 
 
 
378 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.27 
 
 
382 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.73 
 
 
378 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.73 
 
 
378 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.4 
 
 
375 aa  293  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  57.28 
 
 
219 aa  257  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.14 
 
 
483 aa  119  6e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  29.17 
 
 
404 aa  120  6e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.69 
 
 
483 aa  119  7e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.08 
 
 
485 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.13 
 
 
485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.18 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  27.49 
 
 
357 aa  114  3e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.8 
 
 
486 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.9 
 
 
483 aa  113  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.84 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  46.61 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  36.18 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  27.62 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.17 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.91 
 
 
493 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  26.8 
 
 
373 aa  109  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.82 
 
 
485 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.54 
 
 
485 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.13 
 
 
516 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.73 
 
 
485 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.4 
 
 
487 aa  107  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.81 
 
 
484 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1127  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.27 
 
 
382 aa  107  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000270815  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.58 
 
 
483 aa  106  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.53 
 
 
508 aa  106  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.69 
 
 
490 aa  105  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.84 
 
 
482 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.66 
 
 
486 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.02 
 
 
498 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.84 
 
 
482 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3124  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
490 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119862  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.55 
 
 
486 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.59 
 
 
486 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  28.53 
 
 
384 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.01 
 
 
498 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.07 
 
 
488 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.86 
 
 
488 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.98 
 
 
488 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>