More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0907 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  100 
 
 
388 aa  769    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  71.47 
 
 
385 aa  541  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.98 
 
 
378 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  73.32 
 
 
378 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.87 
 
 
382 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.28 
 
 
378 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.28 
 
 
378 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71.8 
 
 
375 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.06 
 
 
377 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.46 
 
 
377 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  58.29 
 
 
387 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  55.61 
 
 
372 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  59.95 
 
 
375 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  59.09 
 
 
387 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  55.09 
 
 
372 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.52 
 
 
370 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  53.97 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  58.18 
 
 
383 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  54.01 
 
 
374 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.02 
 
 
368 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  52.36 
 
 
378 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  53.65 
 
 
369 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.3 
 
 
374 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  51.3 
 
 
376 aa  382  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  55.53 
 
 
372 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.78 
 
 
374 aa  380  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  54.01 
 
 
374 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.57 
 
 
373 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  52.48 
 
 
373 aa  378  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  54.01 
 
 
374 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  59.5 
 
 
352 aa  363  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.4 
 
 
376 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.3 
 
 
369 aa  359  6e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.52 
 
 
381 aa  350  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.52 
 
 
378 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.17 
 
 
378 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  52.12 
 
 
369 aa  327  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  49.87 
 
 
396 aa  323  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.26 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.61 
 
 
387 aa  318  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.83 
 
 
386 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.81 
 
 
433 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.6 
 
 
387 aa  263  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.89 
 
 
381 aa  262  6e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  39.15 
 
 
381 aa  262  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.29 
 
 
387 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.62 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
387 aa  259  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  34.99 
 
 
387 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.64 
 
 
387 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.63 
 
 
387 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.63 
 
 
387 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
387 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.85 
 
 
384 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.6 
 
 
388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
387 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
387 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  37.86 
 
 
387 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.43 
 
 
391 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.34 
 
 
387 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.34 
 
 
387 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  44.5 
 
 
219 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  26.34 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.99 
 
 
490 aa  86.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.52 
 
 
485 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  26.77 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.4 
 
 
498 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
495 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.76 
 
 
486 aa  84  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.53 
 
 
498 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.4 
 
 
486 aa  82.8  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.47 
 
 
498 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.23 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.85 
 
 
487 aa  82.4  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.8 
 
 
483 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.61 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.65 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.65 
 
 
508 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.33 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.85 
 
 
490 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  33.6 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  26.63 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.16 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.53 
 
 
484 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.16 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.71 
 
 
482 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.99 
 
 
485 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.23 
 
 
490 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.49 
 
 
498 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.01 
 
 
482 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.71 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3124  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.72 
 
 
490 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119862  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.06 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.87 
 
 
486 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  30 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.2 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0525  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.68 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.72 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
556 aa  77  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02973  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  33.79 
 
 
446 aa  77  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.64339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>