More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07610 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  100 
 
 
373 aa  749    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  79.73 
 
 
374 aa  598  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  79.73 
 
 
374 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  76.76 
 
 
374 aa  567  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  78.59 
 
 
374 aa  559  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  76.14 
 
 
373 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  71.35 
 
 
372 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  71.31 
 
 
372 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  70.86 
 
 
378 aa  531  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  76.08 
 
 
381 aa  529  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.21 
 
 
368 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.29 
 
 
370 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.56 
 
 
374 aa  519  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  66.76 
 
 
376 aa  514  1.0000000000000001e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  70.19 
 
 
372 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  67.03 
 
 
370 aa  512  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  69.02 
 
 
369 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.46 
 
 
378 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.46 
 
 
378 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  73.22 
 
 
369 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.49 
 
 
369 aa  484  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  58.82 
 
 
376 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  57.45 
 
 
387 aa  393  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  55.28 
 
 
383 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.71 
 
 
386 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  55.59 
 
 
396 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  54.59 
 
 
387 aa  381  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.79 
 
 
377 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.95 
 
 
377 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  55.12 
 
 
387 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.91 
 
 
376 aa  358  6e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.62 
 
 
378 aa  349  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  53.12 
 
 
375 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  50.93 
 
 
385 aa  346  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  52.48 
 
 
388 aa  344  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  55.11 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.39 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.39 
 
 
378 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.39 
 
 
378 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.59 
 
 
387 aa  329  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.12 
 
 
375 aa  328  7e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.32 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.23 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  42.66 
 
 
433 aa  325  9e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.57 
 
 
387 aa  324  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  45.38 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.47 
 
 
387 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  43.77 
 
 
381 aa  319  5e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.47 
 
 
387 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.21 
 
 
381 aa  318  7.999999999999999e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.21 
 
 
381 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.3 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.81 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  41.35 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.81 
 
 
387 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.47 
 
 
391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  44.57 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.54 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.51 
 
 
388 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  42.39 
 
 
387 aa  293  5e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.48 
 
 
387 aa  293  5e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  52.82 
 
 
219 aa  206  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  27.53 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  24.8 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  23.56 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  26.84 
 
 
357 aa  95.1  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  38.98 
 
 
124 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1127  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.51 
 
 
382 aa  94.7  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000270815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.6 
 
 
508 aa  93.2  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 
485 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.21 
 
 
483 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.43 
 
 
485 aa  90.5  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.77 
 
 
488 aa  90.1  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.55 
 
 
487 aa  90.1  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.51 
 
 
486 aa  90.1  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.71 
 
 
483 aa  89.7  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.74 
 
 
483 aa  89.4  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.01 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.44 
 
 
482 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.44 
 
 
482 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.76 
 
 
489 aa  87  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.77 
 
 
490 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.4 
 
 
481 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.98 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.55 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2902  hypothetical protein  24.18 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.91 
 
 
482 aa  84  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2755  hypothetical protein  24.18 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.9 
 
 
483 aa  84  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.91 
 
 
498 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.38 
 
 
489 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.09 
 
 
497 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.82 
 
 
486 aa  83.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.99 
 
 
482 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.52 
 
 
482 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.51 
 
 
486 aa  83.6  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.54 
 
 
486 aa  83.6  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.52 
 
 
482 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.98 
 
 
498 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.88 
 
 
488 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>