More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04750 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
377 aa  749    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.53 
 
 
377 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  65.62 
 
 
385 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.16 
 
 
378 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  65.46 
 
 
388 aa  458  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.37 
 
 
378 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.32 
 
 
382 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.32 
 
 
378 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.32 
 
 
378 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  64.08 
 
 
375 aa  431  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.6 
 
 
375 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  57.25 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  59.63 
 
 
383 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  58.18 
 
 
372 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  57.91 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  56.72 
 
 
370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.18 
 
 
370 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  58.03 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  55.97 
 
 
374 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  57.1 
 
 
369 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  51.72 
 
 
376 aa  390  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  56.68 
 
 
372 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  54.79 
 
 
373 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  51.97 
 
 
378 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  56.23 
 
 
374 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.65 
 
 
369 aa  376  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.3 
 
 
368 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.26 
 
 
374 aa  372  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.97 
 
 
374 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  56.23 
 
 
374 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  59.22 
 
 
352 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.03 
 
 
373 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.74 
 
 
376 aa  358  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.13 
 
 
378 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.44 
 
 
381 aa  351  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.67 
 
 
378 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.1 
 
 
387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  50.54 
 
 
396 aa  332  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  50.4 
 
 
369 aa  322  5e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.8 
 
 
376 aa  316  5e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.92 
 
 
386 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.5 
 
 
433 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.97 
 
 
387 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.97 
 
 
387 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.97 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.64 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37 
 
 
387 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.13 
 
 
381 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.4 
 
 
381 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  39.4 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.64 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.63 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  41.94 
 
 
384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  41.4 
 
 
387 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  41.4 
 
 
387 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.83 
 
 
387 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  39.57 
 
 
387 aa  255  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  41.44 
 
 
391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.52 
 
 
388 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.77 
 
 
387 aa  246  4e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.77 
 
 
387 aa  239  6.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  46.19 
 
 
219 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  39.34 
 
 
124 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.43 
 
 
497 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.66 
 
 
498 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.95 
 
 
485 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.84 
 
 
498 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.56 
 
 
495 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.38 
 
 
483 aa  88.6  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.43 
 
 
498 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.69 
 
 
488 aa  86.3  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.47 
 
 
486 aa  86.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  25.4 
 
 
404 aa  86.3  9e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  27.27 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  39.74 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.49 
 
 
508 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.18 
 
 
490 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.73 
 
 
486 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.48 
 
 
490 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.29 
 
 
496 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.98 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.49 
 
 
486 aa  84  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.15 
 
 
498 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.98 
 
 
494 aa  84  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.63 
 
 
486 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.52 
 
 
483 aa  83.2  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  34.52 
 
 
484 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.87 
 
 
489 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.73 
 
 
489 aa  82  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.03 
 
 
485 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.17 
 
 
482 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  25.19 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.31 
 
 
498 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.17 
 
 
482 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.15 
 
 
503 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  27.65 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.43 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02973  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  31.27 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.64339  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.36 
 
 
486 aa  81.6  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.67 
 
 
485 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>