More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2595 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
370 aa  739    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  88.92 
 
 
370 aa  668    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  85.37 
 
 
372 aa  640    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  82.7 
 
 
372 aa  629  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  84.01 
 
 
372 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  73.57 
 
 
374 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.21 
 
 
368 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  70.92 
 
 
369 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71.54 
 
 
373 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.48 
 
 
374 aa  527  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  71.39 
 
 
374 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  68.29 
 
 
373 aa  523  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  70.65 
 
 
374 aa  523  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  67.85 
 
 
376 aa  518  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.84 
 
 
369 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.85 
 
 
374 aa  513  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  64.78 
 
 
378 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71.12 
 
 
381 aa  492  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.27 
 
 
378 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.19 
 
 
378 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  65.03 
 
 
369 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.49 
 
 
386 aa  430  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.96 
 
 
387 aa  426  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  60.05 
 
 
376 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  59.95 
 
 
383 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  57.48 
 
 
387 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  61.31 
 
 
396 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  57.74 
 
 
387 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.18 
 
 
377 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.18 
 
 
377 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  57.26 
 
 
376 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  57.39 
 
 
352 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  54.96 
 
 
375 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  51.98 
 
 
385 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  53.52 
 
 
388 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.64 
 
 
387 aa  360  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.61 
 
 
433 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.88 
 
 
378 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.15 
 
 
387 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.84 
 
 
378 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.15 
 
 
387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  45.78 
 
 
387 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.05 
 
 
387 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  45.26 
 
 
387 aa  349  3e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.73 
 
 
387 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.73 
 
 
387 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  45.8 
 
 
387 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  47.38 
 
 
381 aa  346  3e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.03 
 
 
378 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.03 
 
 
378 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.44 
 
 
387 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.68 
 
 
391 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.56 
 
 
381 aa  345  8.999999999999999e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.83 
 
 
381 aa  344  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.52 
 
 
388 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.18 
 
 
384 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.76 
 
 
375 aa  341  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.72 
 
 
382 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  47.97 
 
 
387 aa  337  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.28 
 
 
387 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.1 
 
 
387 aa  327  3e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  57.14 
 
 
219 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  29.71 
 
 
404 aa  103  4e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  27.84 
 
 
373 aa  102  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.44 
 
 
485 aa  102  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  43.59 
 
 
124 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.38 
 
 
482 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.38 
 
 
482 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  29.34 
 
 
357 aa  100  5e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.22 
 
 
483 aa  99.4  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.85 
 
 
487 aa  98.6  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  27.3 
 
 
380 aa  96.7  5e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.4 
 
 
483 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.82 
 
 
508 aa  95.5  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.47 
 
 
486 aa  95.5  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.13 
 
 
481 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.01 
 
 
482 aa  95.5  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.31 
 
 
489 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.72 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.6 
 
 
486 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.37 
 
 
483 aa  92.8  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.17 
 
 
488 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.2 
 
 
482 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.17 
 
 
488 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.37 
 
 
485 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.73 
 
 
488 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.31 
 
 
488 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
488 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
488 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
488 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.75 
 
 
488 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.47 
 
 
489 aa  90.5  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44 
 
 
489 aa  90.1  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
488 aa  89.7  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.75 
 
 
488 aa  89.7  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.25 
 
 
488 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  46.41 
 
 
498 aa  89.4  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0651  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
485 aa  89.4  9e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.62 
 
 
504 aa  89.4  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  45.39 
 
 
498 aa  89  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>