More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  89.81 
 
 
374 aa  681    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  88.2 
 
 
374 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  100 
 
 
374 aa  749    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  86.1 
 
 
374 aa  625  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  82.75 
 
 
373 aa  605  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  87.33 
 
 
381 aa  603  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  76.76 
 
 
373 aa  589  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  75.2 
 
 
372 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  74.53 
 
 
372 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  74.06 
 
 
374 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  71.54 
 
 
378 aa  557  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71.39 
 
 
370 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  74.04 
 
 
368 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  71.47 
 
 
370 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  77.13 
 
 
378 aa  545  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  76.8 
 
 
378 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  74.18 
 
 
372 aa  547  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  69.62 
 
 
376 aa  540  9.999999999999999e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  70.57 
 
 
369 aa  531  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  75.2 
 
 
369 aa  508  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.03 
 
 
369 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.49 
 
 
387 aa  429  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  56.74 
 
 
387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  58.76 
 
 
376 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  58.31 
 
 
396 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  56.91 
 
 
383 aa  398  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  57.34 
 
 
386 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  56.22 
 
 
387 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.23 
 
 
377 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.99 
 
 
377 aa  381  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  57.95 
 
 
376 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  57.95 
 
 
352 aa  363  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  52.22 
 
 
385 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  54.01 
 
 
388 aa  360  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  53.91 
 
 
375 aa  358  9e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.06 
 
 
378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.74 
 
 
387 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.61 
 
 
433 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.64 
 
 
387 aa  343  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.28 
 
 
387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.28 
 
 
387 aa  342  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50 
 
 
387 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50 
 
 
387 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.23 
 
 
375 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.08 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.66 
 
 
378 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.54 
 
 
381 aa  336  5e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.86 
 
 
384 aa  335  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  46.81 
 
 
381 aa  335  7.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.91 
 
 
387 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  45.71 
 
 
381 aa  333  3e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.89 
 
 
382 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.74 
 
 
387 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.33 
 
 
378 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.33 
 
 
378 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.57 
 
 
387 aa  329  4e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.57 
 
 
387 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.91 
 
 
388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  48.1 
 
 
387 aa  323  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.83 
 
 
387 aa  322  9.000000000000001e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.64 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  54.31 
 
 
219 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  46.61 
 
 
124 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  29.76 
 
 
357 aa  107  2e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  27.69 
 
 
404 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  27.79 
 
 
380 aa  107  4e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  25.4 
 
 
373 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1127  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.97 
 
 
382 aa  104  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000270815  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.53 
 
 
380 aa  99  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
483 aa  97.8  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.98 
 
 
482 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.98 
 
 
482 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.71 
 
 
487 aa  92.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  28.57 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.51 
 
 
483 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.83 
 
 
486 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.38 
 
 
498 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.69 
 
 
498 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.23 
 
 
483 aa  90.5  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.58 
 
 
485 aa  89.7  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.19 
 
 
508 aa  89.4  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0651  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.84 
 
 
485 aa  89.4  9e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.44 
 
 
486 aa  89.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.54 
 
 
488 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  33 
 
 
484 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.33 
 
 
489 aa  87  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.78 
 
 
488 aa  86.7  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.98 
 
 
495 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.19 
 
 
483 aa  86.3  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.51 
 
 
482 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.58 
 
 
486 aa  86.7  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.51 
 
 
482 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.19 
 
 
488 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.28 
 
 
482 aa  86.3  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.03 
 
 
482 aa  86.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.94 
 
 
496 aa  86.3  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.76 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.06 
 
 
485 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.93 
 
 
486 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.74 
 
 
485 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>