More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0690 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  779    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  99.22 
 
 
387 aa  773    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  78.29 
 
 
388 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.19 
 
 
433 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.19 
 
 
387 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  77.52 
 
 
387 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.19 
 
 
387 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  76.49 
 
 
387 aa  599  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.61 
 
 
387 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.87 
 
 
387 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71.83 
 
 
387 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  76.49 
 
 
387 aa  592  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  74.94 
 
 
387 aa  580  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  74.42 
 
 
387 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  74.42 
 
 
387 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  73.89 
 
 
384 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.09 
 
 
391 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  56.33 
 
 
381 aa  424  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.8 
 
 
381 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.06 
 
 
381 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.75 
 
 
386 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  49.18 
 
 
372 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  50.26 
 
 
396 aa  363  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  48.37 
 
 
372 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.15 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  77.17 
 
 
219 aa  353  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  47.28 
 
 
370 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.78 
 
 
387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  46.2 
 
 
374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.99 
 
 
368 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  47.45 
 
 
372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  47.01 
 
 
374 aa  328  7e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  44.32 
 
 
373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.01 
 
 
373 aa  326  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  47.28 
 
 
374 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  45.36 
 
 
369 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  45.78 
 
 
369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  42.63 
 
 
378 aa  315  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  43.75 
 
 
376 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  42.93 
 
 
374 aa  312  6.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  45.65 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.01 
 
 
381 aa  303  5.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  45.75 
 
 
369 aa  299  5e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.77 
 
 
378 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  45.97 
 
 
378 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  39.57 
 
 
383 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  39.53 
 
 
387 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.97 
 
 
377 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.24 
 
 
377 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.37 
 
 
376 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  38.48 
 
 
387 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  40.51 
 
 
352 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  36.83 
 
 
375 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  35.2 
 
 
385 aa  223  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.47 
 
 
376 aa  216  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.12 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  35.25 
 
 
388 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.19 
 
 
378 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.19 
 
 
378 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.19 
 
 
378 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.92 
 
 
375 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.11 
 
 
382 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  69.75 
 
 
124 aa  173  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.63 
 
 
482 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  28.22 
 
 
404 aa  120  3e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.63 
 
 
482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  29.58 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.6 
 
 
483 aa  119  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.93 
 
 
483 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  28.27 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.61 
 
 
485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.77 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.82 
 
 
488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.75 
 
 
488 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.36 
 
 
508 aa  113  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.14 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.11 
 
 
488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.98 
 
 
482 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.62 
 
 
486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.21 
 
 
498 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.61 
 
 
496 aa  110  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.53 
 
 
485 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1078  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.24 
 
 
485 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.472537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.78 
 
 
489 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.1 
 
 
484 aa  109  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.44 
 
 
485 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.06 
 
 
486 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  27.25 
 
 
384 aa  109  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1201  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
485 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.795344  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.06 
 
 
486 aa  109  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.59 
 
 
487 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.65 
 
 
488 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.46 
 
 
487 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.04 
 
 
488 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0664  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
485 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.116725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  29.57 
 
 
484 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.83 
 
 
487 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.33 
 
 
485 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.57 
 
 
485 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.44 
 
 
481 aa  107  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>