More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1168 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  97.35 
 
 
378 aa  680    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
378 aa  752    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  91.62 
 
 
382 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
378 aa  752    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  91.25 
 
 
378 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  89.84 
 
 
375 aa  614  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  77.02 
 
 
385 aa  567  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  72.28 
 
 
388 aa  508  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.29 
 
 
377 aa  492  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.32 
 
 
377 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  62.3 
 
 
375 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  60.47 
 
 
387 aa  408  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  59.31 
 
 
383 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  55.11 
 
 
372 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  55.65 
 
 
372 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  59.43 
 
 
387 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.03 
 
 
370 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  53.19 
 
 
378 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  53.76 
 
 
370 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  53.39 
 
 
373 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  52.13 
 
 
374 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  53.08 
 
 
369 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  49.73 
 
 
376 aa  363  3e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  52.94 
 
 
372 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  51.33 
 
 
374 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.82 
 
 
368 aa  352  8e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.07 
 
 
374 aa  351  8.999999999999999e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.69 
 
 
373 aa  349  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.34 
 
 
369 aa  345  7e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.72 
 
 
374 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  56.58 
 
 
352 aa  342  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  52.13 
 
 
374 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.03 
 
 
378 aa  339  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.79 
 
 
376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.96 
 
 
378 aa  335  9e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.06 
 
 
381 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  51.9 
 
 
369 aa  313  4.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.46 
 
 
376 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  47.85 
 
 
396 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.73 
 
 
387 aa  297  3e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.77 
 
 
386 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.61 
 
 
433 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.87 
 
 
387 aa  259  7e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.63 
 
 
387 aa  259  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.8 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.42 
 
 
381 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  38.69 
 
 
381 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.87 
 
 
381 aa  249  6e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.8 
 
 
387 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.95 
 
 
387 aa  246  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.35 
 
 
384 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.43 
 
 
388 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.19 
 
 
387 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.19 
 
 
387 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  38.61 
 
 
387 aa  235  9e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.81 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.81 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.21 
 
 
391 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.34 
 
 
387 aa  222  8e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.87 
 
 
387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  47.4 
 
 
219 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  25.45 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.13 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  25.57 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
495 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  33.61 
 
 
124 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.55 
 
 
486 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.02 
 
 
498 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.05 
 
 
498 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3045  GMP reductase  32.52 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.32 
 
 
488 aa  76.3  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.54 
 
 
498 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.47 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.08 
 
 
486 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.22 
 
 
498 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  28.62 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.3 
 
 
485 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.18 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.91 
 
 
487 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.93 
 
 
497 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.45 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.93 
 
 
496 aa  73.2  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3266  GMP reductase  30.88 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.47 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.24 
 
 
483 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.52 
 
 
508 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.21 
 
 
485 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.92 
 
 
482 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.92 
 
 
482 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1766  IMP dehydrogenase/GMP reductase  32.06 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.89 
 
 
490 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.41 
 
 
488 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.3 
 
 
489 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.68 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1752  GMP reductase  30.41 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.462068  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.42 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.43 
 
 
484 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.93 
 
 
485 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.83 
 
 
482 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>