More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1752 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1752  GMP reductase  100 
 
 
385 aa  756    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.462068  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1958  GMP reductase  53.35 
 
 
385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.77 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3045  GMP reductase  46.54 
 
 
374 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  41.49 
 
 
380 aa  280  2e-74  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  41.33 
 
 
384 aa  276  6e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1127  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.62 
 
 
382 aa  275  7e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000270815  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3266  GMP reductase  45.43 
 
 
368 aa  269  8e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1766  IMP dehydrogenase/GMP reductase  47.77 
 
 
369 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.36 
 
 
508 aa  264  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.64 
 
 
483 aa  263  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  37.77 
 
 
373 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  48.38 
 
 
488 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  48.73 
 
 
488 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  48.5 
 
 
484 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  39.62 
 
 
357 aa  256  6e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.57 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.57 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.05 
 
 
482 aa  252  6e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.05 
 
 
482 aa  252  6e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.5 
 
 
486 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.5 
 
 
488 aa  250  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.53 
 
 
483 aa  249  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.12 
 
 
488 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.68 
 
 
485 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.27 
 
 
485 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.58 
 
 
494 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  48 
 
 
487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  45.52 
 
 
484 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.82 
 
 
484 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.57 
 
 
476 aa  243  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  48 
 
 
487 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  48 
 
 
487 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  47.64 
 
 
487 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  47.64 
 
 
487 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  47.64 
 
 
487 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  48.36 
 
 
487 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  47.64 
 
 
487 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  48 
 
 
487 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.04 
 
 
493 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  46.55 
 
 
487 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  48 
 
 
487 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.89 
 
 
504 aa  238  9e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.35 
 
 
490 aa  238  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.82 
 
 
493 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.48 
 
 
497 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.88 
 
 
485 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02973  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  48.21 
 
 
446 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.64339  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.39 
 
 
486 aa  238  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.79 
 
 
486 aa  237  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.74 
 
 
489 aa  237  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.77 
 
 
485 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.7 
 
 
489 aa  236  4e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.95 
 
 
490 aa  236  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.55 
 
 
496 aa  235  8e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.95 
 
 
507 aa  235  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0788  IMP dehydrogenase  47.33 
 
 
497 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.96 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.68 
 
 
496 aa  234  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  32.74 
 
 
404 aa  232  7.000000000000001e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.07 
 
 
485 aa  232  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  46.07 
 
 
485 aa  231  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.68 
 
 
547 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.27 
 
 
492 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07600  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.62 
 
 
498 aa  229  5e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.194742 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1488  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.33 
 
 
497 aa  229  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  44.17 
 
 
493 aa  229  5e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.71 
 
 
503 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  44.13 
 
 
493 aa  229  8e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.29 
 
 
491 aa  229  8e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.98 
 
 
483 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0489  IMP dehydrogenase  45.91 
 
 
497 aa  228  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  46.98 
 
 
489 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.41 
 
 
489 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  45.52 
 
 
499 aa  227  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.08 
 
 
514 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.17 
 
 
484 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.67 
 
 
497 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50 
 
 
496 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.63 
 
 
496 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  48.51 
 
 
498 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.53 
 
 
504 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  49.07 
 
 
495 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  48.7 
 
 
498 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.74 
 
 
497 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.67 
 
 
496 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  47.76 
 
 
497 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.67 
 
 
496 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.33 
 
 
496 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.77 
 
 
485 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.06 
 
 
491 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.62 
 
 
491 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.23 
 
 
490 aa  222  8e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.23 
 
 
490 aa  222  8e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.71 
 
 
491 aa  222  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.63 
 
 
487 aa  222  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.81 
 
 
556 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.92 
 
 
380 aa  221  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.21 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1716  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.45 
 
 
489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.626692  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>