More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1958 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1958  GMP reductase  100 
 
 
385 aa  750    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1752  GMP reductase  53.35 
 
 
385 aa  356  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.462068  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  42.74 
 
 
373 aa  293  5e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.51 
 
 
380 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  40.75 
 
 
380 aa  285  9e-76  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  42.09 
 
 
384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3045  GMP reductase  44.51 
 
 
374 aa  279  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1127  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.73 
 
 
382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000270815  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.13 
 
 
404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3266  GMP reductase  43.96 
 
 
368 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.58 
 
 
483 aa  263  4e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.45 
 
 
482 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.45 
 
 
482 aa  262  8e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1766  IMP dehydrogenase/GMP reductase  43.48 
 
 
369 aa  260  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.69 
 
 
508 aa  259  6e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  47.25 
 
 
488 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.99 
 
 
476 aa  255  9e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.37 
 
 
489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.95 
 
 
494 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.12 
 
 
488 aa  253  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
484 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  45.95 
 
 
488 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.6 
 
 
488 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.63 
 
 
486 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  40.54 
 
 
357 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.44 
 
 
486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  41.64 
 
 
484 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.13 
 
 
492 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.85 
 
 
485 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.37 
 
 
485 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48 
 
 
484 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.9 
 
 
489 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.12 
 
 
504 aa  240  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.08 
 
 
496 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.08 
 
 
496 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.08 
 
 
496 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.16 
 
 
488 aa  238  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.48 
 
 
488 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.48 
 
 
488 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.88 
 
 
490 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.79 
 
 
483 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  43.04 
 
 
487 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.65 
 
 
483 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  43.04 
 
 
487 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  43.04 
 
 
487 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  42.72 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  42.72 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  42.72 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  42.72 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.25 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  43.04 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.31 
 
 
493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.27 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.34 
 
 
492 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  42.72 
 
 
487 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.41 
 
 
491 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  42.72 
 
 
487 aa  233  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.91 
 
 
489 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2687  Malate dehydrogenase  42.15 
 
 
354 aa  232  8.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.608571  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.07 
 
 
497 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.85 
 
 
500 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.35 
 
 
491 aa  232  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  42.39 
 
 
487 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.75 
 
 
497 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48 
 
 
483 aa  231  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.1 
 
 
496 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  43.25 
 
 
493 aa  229  6e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.08 
 
 
489 aa  229  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.37 
 
 
485 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.32 
 
 
556 aa  229  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  45.76 
 
 
498 aa  229  8e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.64 
 
 
496 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  44.75 
 
 
499 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.79 
 
 
496 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.33 
 
 
493 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.76 
 
 
496 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.6 
 
 
489 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.08 
 
 
497 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  45.76 
 
 
498 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.69 
 
 
490 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  46.67 
 
 
489 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.88 
 
 
491 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3052  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  46.13 
 
 
497 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.61 
 
 
510 aa  226  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.89 
 
 
380 aa  225  9e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  42.64 
 
 
493 aa  225  9e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1716  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.71 
 
 
489 aa  225  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.626692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  45.12 
 
 
497 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.39 
 
 
484 aa  225  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  42.11 
 
 
493 aa  225  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.26 
 
 
516 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.06 
 
 
514 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0788  IMP dehydrogenase  46.07 
 
 
497 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.86 
 
 
498 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0651  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  46.45 
 
 
485 aa  224  2e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1488  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.17 
 
 
497 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  45.79 
 
 
497 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0489  IMP dehydrogenase  45.77 
 
 
497 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.96 
 
 
497 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  49.24 
 
 
485 aa  223  6e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>