49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3700 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3700  Carotenoid oxygenase  100 
 
 		 560 aa  1129    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2295  lignostilbene-alpha beta-dioxygenase and related enzymes-like  30.39 
 
 		 565 aa  205  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.251265  normal  0.0207364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7005  hypothetical protein  29.11 
 
 		 552 aa  204  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0904061  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1630  hypothetical protein  28.57 
 
 		 593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  23.59 
 
 		 495 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  23.39 
 
 		 495 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  24.14 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  25.23 
 
 		 481 aa  73.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  25.44 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  25.9 
 
 		 555 aa  67  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  25.77 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  24.88 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  23.59 
 
 		 487 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  31.11 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  22.05 
 
 		 765 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  23.59 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1244  carotenoid oxygenase  25.65 
 
 		 556 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0442261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  26.74 
 
 		 510 aa  57  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4021  predicted protein  29.55 
 
 		 163 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.274127  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1288  carotenoid oxygenase  25.65 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1322  carotenoid oxygenase  25.65 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3066  Carotenoid oxygenase  24.12 
 
 		 558 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.061004  hitchhiker  0.0000000132751 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  24.9 
 
 		 507 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  26.57 
 
 		 495 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  24.42 
 
 		 508 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  24.42 
 
 		 508 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  22.83 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  28.95 
 
 		 515 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86865  predicted protein  23.44 
 
 		 554 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241734 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  22.26 
 
 		 914 aa  50.8  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  23.14 
 
 		 497 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  21.25 
 
 		 463 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  26.22 
 
 		 464 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  27.17 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  21.67 
 
 		 477 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  26.28 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  39.22 
 
 		 514 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  23.81 
 
 		 464 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  23.47 
 
 		 551 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  22.93 
 
 		 483 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  25.56 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  26.1 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  25.12 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  26.03 
 
 		 466 aa  45.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  40 
 
 		 502 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  31.37 
 
 		 489 aa  44.3  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  25.11 
 
 		 494 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48408  predicted protein  26.83 
 
 		 577 aa  44.3  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  22.75 
 
 		 487 aa  43.9  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>