18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1630 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2295  lignostilbene-alpha beta-dioxygenase and related enzymes-like  71.86 
 
 		 565 aa  830    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.251265  normal  0.0207364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1630  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1196    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7005  hypothetical protein  67.93 
 
 		 552 aa  784    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0904061  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3700  Carotenoid oxygenase  28.57 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101903  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  24.12 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  34.07 
 
 		 494 aa  48.9  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  30.23 
 
 		 481 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  23.49 
 
 		 467 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  38.46 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  38.46 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  34.34 
 
 		 460 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  34.02 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  32.08 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  37.84 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4537  carotenoid oxygenase  40.45 
 
 		 411 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.368379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  37.84 
 
 		 443 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  26.02 
 
 		 555 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  24.33 
 
 		 502 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>