17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2295 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2295  lignostilbene-alpha beta-dioxygenase and related enzymes-like  100 
 
 		 565 aa  1132    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.251265  normal  0.0207364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7005  hypothetical protein  67.26 
 
 		 552 aa  790    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0904061  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1630  hypothetical protein  71.86 
 
 		 593 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3700  Carotenoid oxygenase  30.39 
 
 		 560 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101903  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  21.13 
 
 		 495 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  21.32 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  22.3 
 
 		 555 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  30.65 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  30.23 
 
 		 445 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  30.23 
 
 		 445 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  22.22 
 
 		 510 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  24.91 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  30.3 
 
 		 460 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  29.01 
 
 		 445 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  36.14 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  22.14 
 
 		 489 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  36.14 
 
 		 445 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>