13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7005 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2295  lignostilbene-alpha beta-dioxygenase and related enzymes-like  67.26 
 
 		 565 aa  790    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.251265  normal  0.0207364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1630  hypothetical protein  67.93 
 
 		 593 aa  784    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7005  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1118    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0904061  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3700  Carotenoid oxygenase  29.11 
 
 		 560 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101903  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  21.46 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  23.86 
 
 		 467 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  29.41 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  29.41 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.02 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  23.1 
 
 		 510 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  28.57 
 
 		 445 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  28.45 
 
 		 443 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  34.18 
 
 		 445 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>