202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1543 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  45.37 
 
 		 747 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  55.35 
 
 		 699 aa  769    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  53.99 
 
 		 702 aa  772    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  56.49 
 
 		 701 aa  831    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  100 
 
 		 709 aa  1484    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  48.22 
 
 		 701 aa  704    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  58.45 
 
 		 726 aa  849    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  54.76 
 
 		 704 aa  763    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  56.21 
 
 		 701 aa  830    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  56.44 
 
 		 727 aa  832    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  54.77 
 
 		 699 aa  775    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  55.06 
 
 		 699 aa  779    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  55.2 
 
 		 699 aa  780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  53.99 
 
 		 702 aa  772    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  54.33 
 
 		 709 aa  773    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  48.08 
 
 		 703 aa  663    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  57.22 
 
 		 716 aa  812    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  55.04 
 
 		 704 aa  764    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  55.04 
 
 		 704 aa  764    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  55.59 
 
 		 700 aa  788    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  56.53 
 
 		 553 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  50 
 
 		 696 aa  718    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  55.33 
 
 		 705 aa  772    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  58.32 
 
 		 702 aa  858    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  54.76 
 
 		 704 aa  763    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  46.35 
 
 		 722 aa  633  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  35.09 
 
 		 933 aa  447  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0090  hypothetical protein  39.26 
 
 		 449 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  38.03 
 
 		 455 aa  300  8e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  49 
 
 		 252 aa  248  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  47.41 
 
 		 252 aa  233  9e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  29.93 
 
 		 439 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  29.66 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  30.02 
 
 		 430 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  25.23 
 
 		 433 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  29.19 
 
 		 432 aa  120  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01670  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 		 1020 aa  117  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  29.3 
 
 		 766 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  29.48 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10996  DUF323 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15650)  23.5 
 
 		 512 aa  110  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.742402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  27.61 
 
 		 417 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  26.45 
 
 		 439 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  27.54 
 
 		 425 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  26.24 
 
 		 432 aa  107  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  28.65 
 
 		 437 aa  107  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  27.91 
 
 		 423 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  30.15 
 
 		 468 aa  106  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  25.06 
 
 		 437 aa  103  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  25.71 
 
 		 429 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  24.12 
 
 		 446 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  24.93 
 
 		 429 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  26.89 
 
 		 444 aa  101  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  28.62 
 
 		 506 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  27.53 
 
 		 424 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  24.53 
 
 		 446 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  28.68 
 
 		 487 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  31.95 
 
 		 280 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  24.53 
 
 		 385 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  26.14 
 
 		 412 aa  99  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  25.69 
 
 		 427 aa  97.4  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  29.5 
 
 		 416 aa  97.4  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  32.09 
 
 		 414 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  26.51 
 
 		 434 aa  97.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  29.92 
 
 		 446 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  27.54 
 
 		 427 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  27.27 
 
 		 385 aa  95.5  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.69 
 
 		 416 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  24.69 
 
 		 416 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  26.44 
 
 		 428 aa  94  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  25.73 
 
 		 434 aa  92.8  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  27.45 
 
 		 444 aa  92.8  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  28 
 
 		 398 aa  92.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  25.28 
 
 		 434 aa  91.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  24.77 
 
 		 398 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  25.82 
 
 		 395 aa  90.9  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  24.95 
 
 		 430 aa  90.5  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  25.65 
 
 		 425 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 313 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  25.5 
 
 		 418 aa  89.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  25.82 
 
 		 453 aa  89.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  25.07 
 
 		 428 aa  88.6  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  27.61 
 
 		 442 aa  89  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  25.82 
 
 		 453 aa  89  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  27.48 
 
 		 437 aa  88.6  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  28.94 
 
 		 313 aa  88.6  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  27.46 
 
 		 388 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  27.43 
 
 		 412 aa  88.6  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  28.25 
 
 		 447 aa  88.2  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  25.66 
 
 		 437 aa  87.8  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 322 aa  87.8  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  28.12 
 
 		 408 aa  87.8  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  26.36 
 
 		 423 aa  87.8  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  26.78 
 
 		 444 aa  87.8  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  26.76 
 
 		 415 aa  87.4  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  27.47 
 
 		 436 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  27.47 
 
 		 436 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  27.47 
 
 		 436 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  25.94 
 
 		 433 aa  87  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  24.23 
 
 		 436 aa  87  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  25.17 
 
 		 383 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>