262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0017 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  59.97 
 
 
727 aa  870    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  55.17 
 
 
699 aa  796    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  76.11 
 
 
701 aa  1138    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  55.83 
 
 
704 aa  789    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  55.83 
 
 
704 aa  789    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  76.49 
 
 
553 aa  897    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  55.68 
 
 
704 aa  787    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  58.32 
 
 
709 aa  858    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  51.01 
 
 
701 aa  762    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  60.29 
 
 
726 aa  880    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  77.25 
 
 
701 aa  1152    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  58.38 
 
 
702 aa  833    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  55.14 
 
 
696 aa  803    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  100 
 
 
702 aa  1451    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  45.92 
 
 
722 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  56.15 
 
 
699 aa  803    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  55.72 
 
 
699 aa  798    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  55.97 
 
 
704 aa  789    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  55.72 
 
 
699 aa  796    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  58.13 
 
 
700 aa  835    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  58.38 
 
 
702 aa  833    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  55.29 
 
 
709 aa  792    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  46.24 
 
 
703 aa  673    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  55.54 
 
 
705 aa  784    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  60.17 
 
 
716 aa  873    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  43.61 
 
 
747 aa  628  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  36.93 
 
 
933 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0090  hypothetical protein  43.35 
 
 
449 aa  362  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  41.96 
 
 
455 aa  348  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  65.18 
 
 
252 aa  340  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  55.14 
 
 
252 aa  264  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  31.03 
 
 
439 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  30.61 
 
 
447 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  30.32 
 
 
430 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01670  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 
1020 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  28.74 
 
 
446 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  26.84 
 
 
766 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  26.03 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  31.5 
 
 
468 aa  115  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  26.5 
 
 
432 aa  112  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  26.42 
 
 
385 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  26.8 
 
 
432 aa  110  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  30.48 
 
 
433 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 
416 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  30.09 
 
 
506 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  25.41 
 
 
416 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  32.06 
 
 
436 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  32.06 
 
 
436 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  32.06 
 
 
436 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  25.44 
 
 
437 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  29.69 
 
 
487 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  30.35 
 
 
442 aa  102  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  26.14 
 
 
417 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  29.47 
 
 
430 aa  101  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  32.73 
 
 
442 aa  101  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  26.73 
 
 
444 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  31.31 
 
 
424 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  30.19 
 
 
439 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 
280 aa  98.6  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  28.21 
 
 
442 aa  98.2  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  24.94 
 
 
395 aa  98.2  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  32.23 
 
 
425 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  27.39 
 
 
434 aa  97.8  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  32.62 
 
 
374 aa  97.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  27.94 
 
 
386 aa  97.4  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  30.29 
 
 
819 aa  97.1  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  26.54 
 
 
437 aa  97.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  25.95 
 
 
412 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  23.4 
 
 
429 aa  95.5  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  29.39 
 
 
446 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  32.16 
 
 
414 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  23.81 
 
 
436 aa  93.6  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  28.81 
 
 
447 aa  94  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  24.01 
 
 
425 aa  93.2  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  26.21 
 
 
430 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  26.45 
 
 
427 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  25.5 
 
 
438 aa  91.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  26.22 
 
 
434 aa  91.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  31.64 
 
 
429 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  25.74 
 
 
423 aa  90.5  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10996  DUF323 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15650)  23.46 
 
 
512 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.742402  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  28.61 
 
 
437 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  27.5 
 
 
444 aa  89  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  24.27 
 
 
427 aa  89  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  23.91 
 
 
428 aa  88.2  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  28.45 
 
 
415 aa  87.4  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  25.42 
 
 
434 aa  87.8  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  26.61 
 
 
412 aa  87.8  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  25.24 
 
 
423 aa  86.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  28.02 
 
 
444 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  24.12 
 
 
383 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  28.27 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  32.02 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  28.27 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  25.24 
 
 
426 aa  84.3  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  24.66 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  24.57 
 
 
429 aa  84  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  29.77 
 
 
437 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  22.5 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  28.17 
 
 
313 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>