264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3422 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  50.94 
 
 		 747 aa  765    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  73.43 
 
 		 699 aa  1089    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  54.51 
 
 		 702 aa  764    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  72.24 
 
 		 704 aa  1068    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  54.33 
 
 		 709 aa  773    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  49.44 
 
 		 701 aa  711    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  56.43 
 
 		 726 aa  793    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  72.1 
 
 		 704 aa  1066    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  54.89 
 
 		 701 aa  770    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  54.51 
 
 		 702 aa  764    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  72.24 
 
 		 704 aa  1069    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  57.1 
 
 		 700 aa  798    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  52.89 
 
 		 722 aa  759    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  73.14 
 
 		 699 aa  1082    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  73.14 
 
 		 699 aa  1080    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  54.78 
 
 		 701 aa  772    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  72.38 
 
 		 705 aa  1071    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  51.07 
 
 		 696 aa  719    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  72.71 
 
 		 699 aa  1076    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  72.1 
 
 		 704 aa  1066    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  55.29 
 
 		 702 aa  792    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  100 
 
 		 709 aa  1476    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  52.92 
 
 		 703 aa  778    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  53.51 
 
 		 727 aa  758    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  56.55 
 
 		 716 aa  798    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  53.68 
 
 		 553 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  36.4 
 
 		 933 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0090  hypothetical protein  40.14 
 
 		 449 aa  337  5e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  40.27 
 
 		 455 aa  314  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  54.13 
 
 		 252 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  47.93 
 
 		 252 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  31.71 
 
 		 439 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  30.89 
 
 		 447 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  31.31 
 
 		 430 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01670  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 		 1020 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  30.67 
 
 		 442 aa  118  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  25 
 
 		 433 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  25.87 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  28.51 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  28.05 
 
 		 437 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  26.88 
 
 		 432 aa  111  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  28.17 
 
 		 432 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  25.89 
 
 		 766 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  26.26 
 
 		 468 aa  109  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  28.44 
 
 		 446 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  26.48 
 
 		 425 aa  108  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  24.37 
 
 		 417 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  28.61 
 
 		 446 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  27.65 
 
 		 430 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  26.8 
 
 		 429 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  26.27 
 
 		 437 aa  105  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  28.1 
 
 		 434 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  26.35 
 
 		 487 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  25.25 
 
 		 383 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  29.1 
 
 		 434 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  28.69 
 
 		 428 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  24.36 
 
 		 436 aa  100  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  28.53 
 
 		 424 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  24.89 
 
 		 434 aa  100  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  26.39 
 
 		 412 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  30.09 
 
 		 433 aa  99.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  28.24 
 
 		 423 aa  99  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  24.94 
 
 		 425 aa  99  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  29.18 
 
 		 506 aa  98.2  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  30.97 
 
 		 398 aa  97.8  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  25.62 
 
 		 447 aa  97.8  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 		 425 aa  97.4  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  24.35 
 
 		 428 aa  97.4  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  25.93 
 
 		 427 aa  97.4  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  25.33 
 
 		 427 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 280 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  27.62 
 
 		 395 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  24.73 
 
 		 444 aa  96.3  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  25.36 
 
 		 441 aa  95.5  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  25.64 
 
 		 429 aa  95.5  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  22.14 
 
 		 416 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.14 
 
 		 416 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  27.79 
 
 		 430 aa  95.1  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  26.19 
 
 		 436 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  26.19 
 
 		 436 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  26.19 
 
 		 436 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  28.25 
 
 		 446 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  26.1 
 
 		 444 aa  94  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  29.5 
 
 		 409 aa  93.6  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  28.37 
 
 		 388 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  25.11 
 
 		 438 aa  92  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  31.17 
 
 		 416 aa  91.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  25.82 
 
 		 437 aa  91.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  28.03 
 
 		 386 aa  90.9  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  27.03 
 
 		 455 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  29.5 
 
 		 819 aa  89.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  26.56 
 
 		 444 aa  89  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  25.58 
 
 		 398 aa  88.2  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  24.43 
 
 		 437 aa  88.2  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  26.84 
 
 		 419 aa  87.8  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  25.93 
 
 		 429 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  27.11 
 
 		 415 aa  87  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  29.65 
 
 		 385 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  28.15 
 
 		 453 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  28.45 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>