240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3757 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  56.12 
 
 		 701 aa  794    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  52.34 
 
 		 747 aa  761    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  91.85 
 
 		 699 aa  1353    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  54.69 
 
 		 700 aa  788    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  54.36 
 
 		 702 aa  774    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  54.68 
 
 		 701 aa  784    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  52.07 
 
 		 696 aa  732    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  55.06 
 
 		 709 aa  779    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  49.64 
 
 		 701 aa  728    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  57.57 
 
 		 726 aa  808    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  54.36 
 
 		 702 aa  774    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  54.14 
 
 		 722 aa  780    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  87.77 
 
 		 704 aa  1290    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  87.77 
 
 		 704 aa  1293    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  55.72 
 
 		 702 aa  798    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  98.28 
 
 		 699 aa  1432    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  100 
 
 		 699 aa  1460    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  52.11 
 
 		 727 aa  753    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  87.77 
 
 		 704 aa  1290    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  98.57 
 
 		 699 aa  1440    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  88.06 
 
 		 705 aa  1293    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  73.14 
 
 		 709 aa  1080    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  54.09 
 
 		 703 aa  782    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  55.83 
 
 		 716 aa  780    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  87.48 
 
 		 704 aa  1288    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  54.43 
 
 		 553 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  37.42 
 
 		 933 aa  486  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0090  hypothetical protein  40.96 
 
 		 449 aa  347  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  38.95 
 
 		 455 aa  314  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  52.48 
 
 		 252 aa  251  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  47.52 
 
 		 252 aa  230  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  30.96 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  27.84 
 
 		 439 aa  184  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  27.88 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01670  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 		 1020 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 280 aa  117  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  25.96 
 
 		 429 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  25.37 
 
 		 429 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  26.69 
 
 		 433 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  26.44 
 
 		 766 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  26.94 
 
 		 412 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  25.06 
 
 		 437 aa  105  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  28.27 
 
 		 506 aa  104  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  26.99 
 
 		 439 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  28.16 
 
 		 442 aa  104  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  27.89 
 
 		 446 aa  104  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  26.46 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  26.49 
 
 		 416 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  26.93 
 
 		 427 aa  101  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.49 
 
 		 416 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  28.53 
 
 		 447 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  24.37 
 
 		 437 aa  99  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  29.21 
 
 		 424 aa  97.8  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  26.39 
 
 		 446 aa  97.4  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  27.97 
 
 		 425 aa  97.4  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  28.41 
 
 		 468 aa  96.3  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  28.57 
 
 		 398 aa  96.3  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  26.3 
 
 		 444 aa  96.3  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  26.65 
 
 		 417 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  27.3 
 
 		 428 aa  94.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  30.27 
 
 		 430 aa  94.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  28.53 
 
 		 487 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  29.28 
 
 		 442 aa  91.3  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  25.29 
 
 		 434 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  29.31 
 
 		 398 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  25.51 
 
 		 415 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  25.29 
 
 		 434 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  25.45 
 
 		 383 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  28.68 
 
 		 416 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  25.54 
 
 		 409 aa  89  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  26.5 
 
 		 423 aa  88.6  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  24.43 
 
 		 434 aa  88.2  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  25.81 
 
 		 415 aa  87.8  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  29.18 
 
 		 386 aa  87.8  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  26.25 
 
 		 385 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  22.73 
 
 		 436 aa  87  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  25.07 
 
 		 432 aa  87  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  26.11 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  24.13 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  23.76 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  26.47 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  25 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  24.05 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  26.16 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  29.82 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  26.1 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  27.78 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  27.56 
 
 		 819 aa  80.9  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  22.84 
 
 		 437 aa  80.5  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33230  predicted protein  30.69 
 
 		 303 aa  79.7  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0061924  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10996  DUF323 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15650)  25.41 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.742402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  26.72 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  25.45 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  27.02 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  29.58 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  24.43 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  24.43 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  24.43 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  24.66 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>