47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0361 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  100 
 
 
252 aa  517  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  59.04 
 
 
716 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  55.14 
 
 
726 aa  281  9e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  55.14 
 
 
702 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  54.4 
 
 
727 aa  263  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  54.1 
 
 
553 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  56.15 
 
 
702 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  56.15 
 
 
702 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  54.13 
 
 
709 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  52.48 
 
 
699 aa  254  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  54.36 
 
 
701 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  52.89 
 
 
705 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  52.89 
 
 
704 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  53.94 
 
 
701 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  52.89 
 
 
704 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  52.48 
 
 
699 aa  251  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  52.48 
 
 
704 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  52.48 
 
 
704 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  52.07 
 
 
699 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  52.07 
 
 
699 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  51.64 
 
 
252 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  47.41 
 
 
709 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  47.93 
 
 
700 aa  231  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  44.53 
 
 
701 aa  209  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  38.49 
 
 
696 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  35.51 
 
 
722 aa  151  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  33.73 
 
 
703 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  31.75 
 
 
747 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  34.46 
 
 
933 aa  132  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  31.4 
 
 
313 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  32.21 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  28.22 
 
 
313 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  28.51 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33230  predicted protein  27.09 
 
 
303 aa  53.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0061924  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
226 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  26.71 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  50.94 
 
 
216 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 
354 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0851  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  33.05 
 
 
432 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954916  hitchhiker  0.000117621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.67 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.168902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  35.29 
 
 
246 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  47.27 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  30.38 
 
 
207 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>