90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2572 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  67.09 
 
 		 313 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  55.91 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  51.75 
 
 		 322 aa  319  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  47.28 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  47.28 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  29.48 
 
 		 716 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  30.48 
 
 		 727 aa  89.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  28.94 
 
 		 709 aa  88.6  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  29.79 
 
 		 726 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  30.58 
 
 		 553 aa  86.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 700 aa  84  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  28.17 
 
 		 702 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  34.48 
 
 		 701 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  26.85 
 
 		 699 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  25.83 
 
 		 722 aa  79  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  28.65 
 
 		 699 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  26.05 
 
 		 699 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  31.07 
 
 		 701 aa  77  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  26.39 
 
 		 699 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  28.9 
 
 		 704 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  28.9 
 
 		 704 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  34.25 
 
 		 701 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  27.91 
 
 		 704 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  27.91 
 
 		 704 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  27.91 
 
 		 705 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  26.39 
 
 		 933 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  29.94 
 
 		 702 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  29.94 
 
 		 702 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  26.6 
 
 		 709 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  23.5 
 
 		 747 aa  66.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1366  methyltransferase type 11  23.4 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  22.36 
 
 		 703 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  44.83 
 
 		 58 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0063  hypothetical protein  42.37 
 
 		 59 aa  50.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000183566  hitchhiker  0.000563902 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  24.53 
 
 		 696 aa  50.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0498  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 281 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136717  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  29.92 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  24.28 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.57 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  24.32 
 
 		 240 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  37.93 
 
 		 61 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  39.66 
 
 		 60 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  37.93 
 
 		 62 aa  46.2  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  39.34 
 
 		 64 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1903  methyltransferase type 11  24.76 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000234501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  28.23 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33230  predicted protein  27.54 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0061924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  35.59 
 
 		 89 aa  44.3  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1295  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.5 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 243 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 243 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 241 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 243 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1369  Methyltransferase type 11  24.36 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0456  methyltransferase type 11  23.01 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.3 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  26.5 
 
 		 236 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  26.5 
 
 		 236 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 265 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 234 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 255 aa  42.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0005  hypothetical protein  40.32 
 
 		 59 aa  42.7  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  26.5 
 
 		 226 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  26.5 
 
 		 226 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  25.64 
 
 		 236 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  41.18 
 
 		 55 aa  42.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  25 
 
 		 241 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 225 aa  42.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>