58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2700 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  56.41 
 
 		 339 aa  353  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  51.6 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  47.28 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  44.48 
 
 		 313 aa  255  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  41.27 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  32.21 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  32.86 
 
 		 716 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  34.65 
 
 		 726 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  31.63 
 
 		 727 aa  72.8  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  28.38 
 
 		 699 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  28.38 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  28.38 
 
 		 699 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  28.38 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  28.43 
 
 		 709 aa  70.1  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  33.78 
 
 		 702 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  27.51 
 
 		 704 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  31.58 
 
 		 701 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  27.51 
 
 		 704 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  27.51 
 
 		 704 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  33.99 
 
 		 701 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  27.51 
 
 		 704 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  27.51 
 
 		 705 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  31.28 
 
 		 700 aa  66.2  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  30 
 
 		 553 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  31.58 
 
 		 702 aa  66.2  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  31.58 
 
 		 702 aa  66.2  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  29.63 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  29.53 
 
 		 933 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  28.77 
 
 		 722 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  23.92 
 
 		 701 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  28.11 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  23.35 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.64 
 
 		 220 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  24.24 
 
 		 747 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  23.77 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  23.77 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  23.77 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 243 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  37.29 
 
 		 61 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 225 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0498  Methyltransferase type 11  24.02 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136717  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.57 
 
 		 199 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  24.37 
 
 		 226 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  34.48 
 
 		 62 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1056  protein of unknown function DUF343  39.66 
 
 		 66 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>