51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0125 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  698    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  56.41 
 
 
312 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  52.56 
 
 
322 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  47.28 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  48.88 
 
 
313 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  43.45 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  31.39 
 
 
709 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  34.55 
 
 
702 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  34.64 
 
 
701 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  31.03 
 
 
553 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  29.02 
 
 
700 aa  75.9  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  34.9 
 
 
701 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  30.53 
 
 
727 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  27.23 
 
 
704 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  28.43 
 
 
716 aa  72.8  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  27.23 
 
 
704 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  28.65 
 
 
709 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  27.23 
 
 
704 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  27.23 
 
 
704 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  28.24 
 
 
699 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  28.51 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  27.23 
 
 
705 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  27.78 
 
 
699 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  28.24 
 
 
699 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  28.57 
 
 
699 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  31.61 
 
 
702 aa  70.1  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  31.61 
 
 
702 aa  70.1  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  29.74 
 
 
726 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  30.45 
 
 
252 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  26.53 
 
 
722 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  27.54 
 
 
933 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  28.28 
 
 
701 aa  56.6  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0498  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 
281 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136717  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  23.35 
 
 
747 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2114  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
276 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420703  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.44 
 
 
296 aa  46.2  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  25.84 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  39.66 
 
 
58 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1755  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1369  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 
208 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2558  methyltransferase type 11  25.2 
 
 
225 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  36.92 
 
 
62 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33230  predicted protein  26.43 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0061924  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  23.49 
 
 
226 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  34.48 
 
 
64 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0005  hypothetical protein  36.21 
 
 
59 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  23.49 
 
 
226 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  38.57 
 
 
236 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  36.21 
 
 
61 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>