254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2978 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  57.84 
 
 
702 aa  638    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  56.53 
 
 
709 aa  661    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  57.53 
 
 
726 aa  671    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  57.84 
 
 
702 aa  638    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  59.13 
 
 
727 aa  678    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  76.49 
 
 
702 aa  897    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
553 aa  1147    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  74.64 
 
 
701 aa  875    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  57.55 
 
 
700 aa  641    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  75.36 
 
 
701 aa  878    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  59.89 
 
 
716 aa  679    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  54.79 
 
 
699 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  53.26 
 
 
699 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  54.43 
 
 
699 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  54.43 
 
 
699 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  53.68 
 
 
709 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  54.07 
 
 
704 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  54.07 
 
 
704 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  53.89 
 
 
704 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  54.43 
 
 
705 aa  599  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  54.07 
 
 
704 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  51.91 
 
 
696 aa  595  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  48.09 
 
 
701 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  46.32 
 
 
703 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  42.88 
 
 
747 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  46.87 
 
 
722 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  36.67 
 
 
933 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  68.85 
 
 
252 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  54.1 
 
 
252 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0090  hypothetical protein  41.78 
 
 
449 aa  257  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  38.82 
 
 
455 aa  228  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  35.65 
 
 
439 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  34.17 
 
 
447 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  32.9 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  32.61 
 
 
766 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  30.86 
 
 
446 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  29.21 
 
 
433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  30.77 
 
 
487 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  29.75 
 
 
442 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  33.09 
 
 
424 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  29.87 
 
 
439 aa  105  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  31.3 
 
 
468 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  28.25 
 
 
434 aa  103  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  29.87 
 
 
506 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  28.21 
 
 
446 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  30.42 
 
 
446 aa  97.4  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  30.07 
 
 
437 aa  97.1  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 
416 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  29.89 
 
 
442 aa  96.7  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  29.47 
 
 
412 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  28.85 
 
 
432 aa  96.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 
280 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  28.27 
 
 
416 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  26.65 
 
 
437 aa  95.1  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  28.62 
 
 
417 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  25.91 
 
 
429 aa  93.6  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  35.84 
 
 
414 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  29.35 
 
 
436 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  31.52 
 
 
447 aa  93.2  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  29.35 
 
 
436 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  29.35 
 
 
436 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  28.01 
 
 
432 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  29.75 
 
 
444 aa  92  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  26.85 
 
 
385 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  27.17 
 
 
434 aa  90.9  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  29.49 
 
 
437 aa  90.5  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  31.44 
 
 
374 aa  90.5  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  27.18 
 
 
386 aa  90.1  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  28.26 
 
 
434 aa  90.1  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  27.57 
 
 
425 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  27.3 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  29.82 
 
 
444 aa  89.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  26.97 
 
 
427 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  27.89 
 
 
428 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  26.28 
 
 
428 aa  87.4  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  30.58 
 
 
313 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  30.24 
 
 
412 aa  86.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  28.95 
 
 
430 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  31.72 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01670  conserved hypothetical protein  24.61 
 
 
1020 aa  85.9  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
313 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  25.59 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  29.25 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  30.19 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  29.04 
 
 
819 aa  84  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  25.43 
 
 
383 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  26.21 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  26.35 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  29.57 
 
 
437 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  30.22 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  28.42 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  29.93 
 
 
416 aa  82.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  27.18 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  27.65 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  27.33 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
374 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  27.95 
 
 
453 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  27.95 
 
 
453 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  25.42 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>