More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0090 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0090  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  934    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  57.21 
 
 
455 aa  544  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  43.58 
 
 
701 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  41.97 
 
 
701 aa  362  8e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  43.35 
 
 
702 aa  362  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  42.5 
 
 
696 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  42.07 
 
 
716 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  38.23 
 
 
933 aa  354  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  41.2 
 
 
699 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  40.83 
 
 
699 aa  351  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  41.65 
 
 
726 aa  349  7e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  41.14 
 
 
699 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  40.96 
 
 
699 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  40.14 
 
 
709 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  37.5 
 
 
703 aa  333  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  39.77 
 
 
704 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  39.26 
 
 
709 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  39.77 
 
 
704 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  39.77 
 
 
704 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  38.68 
 
 
700 aa  325  7e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  39.59 
 
 
702 aa  325  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  39.59 
 
 
702 aa  325  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  37.97 
 
 
705 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  39.32 
 
 
704 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  38.39 
 
 
727 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  38.07 
 
 
701 aa  317  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  38.26 
 
 
747 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  37.89 
 
 
722 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  41.78 
 
 
553 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  30.79 
 
 
447 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  32.03 
 
 
430 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  30.84 
 
 
439 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10996  DUF323 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15650)  25.71 
 
 
512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.742402  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  28.15 
 
 
446 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  27.91 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01670  conserved hypothetical protein  24.39 
 
 
1020 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  27.25 
 
 
412 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  24.68 
 
 
766 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  26.73 
 
 
446 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  26.23 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  26.78 
 
 
442 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  25 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  26.04 
 
 
439 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  26.51 
 
 
437 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  28.12 
 
 
442 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  26.09 
 
 
424 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.72 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  24.36 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  26.99 
 
 
436 aa  110  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  25.68 
 
 
436 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  25.68 
 
 
436 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  25.68 
 
 
436 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  26.11 
 
 
432 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  24.25 
 
 
429 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  24.42 
 
 
430 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  24.75 
 
 
429 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  24.34 
 
 
437 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  27.62 
 
 
506 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  26.33 
 
 
432 aa  100  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  23.06 
 
 
444 aa  99.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  26.81 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  26.68 
 
 
425 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  24 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  27.5 
 
 
442 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  28.48 
 
 
819 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  26.24 
 
 
429 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  25.12 
 
 
438 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  23.73 
 
 
444 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  24.12 
 
 
374 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  25.16 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  25.29 
 
 
446 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  25.14 
 
 
434 aa  93.2  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  26.25 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  25.52 
 
 
425 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  24.21 
 
 
447 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  25.81 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  24.21 
 
 
383 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  23.41 
 
 
427 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  23.09 
 
 
408 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  25.51 
 
 
444 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  26.46 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  24.85 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  22.56 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  25.14 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  24.39 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  23.99 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  22.88 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  23.29 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  28.22 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  24.58 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  24.27 
 
 
434 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  22.87 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  27.17 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  22.56 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  23.08 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  25.1 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  23.7 
 
 
428 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  24.27 
 
 
434 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  23.97 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  23.68 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>