120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2390 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  100 
 
 		 166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  63.19 
 
 		 164 aa  205  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  57.83 
 
 		 167 aa  187  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  56.52 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  56.13 
 
 		 179 aa  163  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  54.78 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  44.38 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  37.42 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  32.97 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  34.57 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  39.62 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  36.25 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  34.55 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  37.58 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  32.79 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  33.7 
 
 		 193 aa  104  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  33.89 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  30.9 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  31.67 
 
 		 193 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  30.6 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  32.6 
 
 		 198 aa  97.1  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  39.39 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  35.37 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  32.93 
 
 		 174 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  36.13 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  32.7 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  35.33 
 
 		 189 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  36.5 
 
 		 163 aa  85.9  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  34.57 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  33.95 
 
 		 163 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  34.09 
 
 		 163 aa  84  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  39.86 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  37.68 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  35.29 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  39.19 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  39.19 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  34.07 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  35.56 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  33.99 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  40.15 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  33.12 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  33.14 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  31.17 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  29.79 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  35.34 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  31.08 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  32.54 
 
 		 180 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  31.82 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  44.44 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  46.67 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  31.36 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  32.54 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  37.1 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  29.48 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  28.49 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  33.09 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  28.09 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  37.17 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  31.88 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  29.78 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  29.21 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  30.15 
 
 		 182 aa  63.9  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  25.41 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  37.18 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  24.72 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  24.72 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  24.72 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  24.72 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  24.72 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  22.65 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  31.73 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  24.72 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  24.72 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  24.72 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  29.67 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.84 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2668  carbonic anhydrase  33.56 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  25.28 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  25.83 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  31.91 
 
 		 291 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  28.11 
 
 		 245 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0017  carbonate dehydratase  27.38 
 
 		 219 aa  51.6  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  28.02 
 
 		 236 aa  50.8  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  29.22 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  26.32 
 
 		 246 aa  50.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  26.17 
 
 		 234 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  26.17 
 
 		 234 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  31 
 
 		 234 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0361  carbonic anhydrase  35.38 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.738606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3958  carbonic anhydrase  29.53 
 
 		 250 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  31.96 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0779  carbonic anhydrase  26.35 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  25.62 
 
 		 238 aa  45.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  23.81 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  27.04 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3786  carbonic anhydrase  27.52 
 
 		 248 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>