144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2168 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  100 
 
 
185 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  61.96 
 
 
186 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  59.78 
 
 
187 aa  249  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  62.09 
 
 
190 aa  248  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  57.07 
 
 
187 aa  241  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  57.07 
 
 
187 aa  241  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  57.07 
 
 
187 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  57.07 
 
 
187 aa  241  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  57.07 
 
 
187 aa  241  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  57.07 
 
 
187 aa  241  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  57.07 
 
 
187 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  57.07 
 
 
187 aa  241  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  59.24 
 
 
187 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  57.07 
 
 
187 aa  228  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  48.9 
 
 
193 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  52.25 
 
 
180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  47.25 
 
 
193 aa  206  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  47.16 
 
 
190 aa  180  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  39.13 
 
 
180 aa  148  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  41.76 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  38.04 
 
 
180 aa  145  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  38.04 
 
 
180 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  39.46 
 
 
181 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  38.38 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  38.96 
 
 
172 aa  117  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  37.09 
 
 
150 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  39.33 
 
 
150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  39.33 
 
 
157 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  37.33 
 
 
150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  38 
 
 
150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  30.11 
 
 
291 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  35.71 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2936  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2957  hypothetical protein  33.12 
 
 
170 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3181  hypothetical protein  33.12 
 
 
170 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.58112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1108  carbonic anhydrase  32.69 
 
 
166 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3189  hypothetical protein  33.12 
 
 
173 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.326929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  29.21 
 
 
164 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  31.63 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
198 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3196  carbonate dehydratase  32.47 
 
 
173 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  31.69 
 
 
192 aa  89  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  32.58 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  33.51 
 
 
192 aa  88.2  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  32.16 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3174  carbonate dehydratase  30.77 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  27.43 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  30.43 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  25.99 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2074  hypothetical protein  29.45 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  30.22 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  28.96 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2872  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  31.84 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  28.11 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  30.77 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  27.81 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  29.67 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  26.09 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  29.78 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  30.52 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  30.34 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  30.67 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  30.67 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  30.67 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  26.09 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  26.09 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  32.45 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  30.67 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  29.41 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  31.37 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  30.82 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  29.56 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  27.62 
 
 
163 aa  72  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  29.33 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3188  hypothetical protein  36.84 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  29.56 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  29.41 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  28.57 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  29.41 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  29.12 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  26.4 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  28.67 
 
 
205 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  28.11 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  26.34 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  25.41 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  31.73 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  27.71 
 
 
189 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  24.88 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  24.12 
 
 
211 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  26.7 
 
 
217 aa  52  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  27.78 
 
 
219 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  27.78 
 
 
223 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  27.72 
 
 
218 aa  51.2  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  29.53 
 
 
219 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  25 
 
 
211 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  25.52 
 
 
211 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  25.68 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  25.77 
 
 
211 aa  48.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  27.81 
 
 
239 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>