95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3273 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  40 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  38.01 
 
 
163 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  38.01 
 
 
163 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  38.01 
 
 
163 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  38.6 
 
 
163 aa  101  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  36.84 
 
 
163 aa  100  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  35.06 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  36.26 
 
 
163 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  38.6 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  36.05 
 
 
165 aa  96.7  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  38.06 
 
 
165 aa  95.9  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  35.52 
 
 
174 aa  94.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  38.1 
 
 
164 aa  94.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  35.71 
 
 
164 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  36.84 
 
 
164 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  36.65 
 
 
175 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  36.72 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  33.54 
 
 
163 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  36.08 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  37.04 
 
 
166 aa  92  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  36.48 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  34.1 
 
 
163 aa  92  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  34.48 
 
 
165 aa  91.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  35.09 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  35.09 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  39.86 
 
 
167 aa  89.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  33.53 
 
 
193 aa  87.8  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
198 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  36.91 
 
 
163 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  36.91 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  30.88 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  35.33 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  35.14 
 
 
141 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  31.64 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  32.5 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  31.93 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  30.94 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  36.99 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  34.94 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  32.8 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  34.19 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  30.43 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  35.06 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  30.82 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  36.99 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  29.48 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  30.14 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  27.63 
 
 
150 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  27.63 
 
 
150 aa  62  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  29.22 
 
 
150 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  29.22 
 
 
157 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  30.82 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  29.81 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  25.32 
 
 
150 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  29.94 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  26.22 
 
 
193 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  27.71 
 
 
185 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  30.53 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  27.27 
 
 
134 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  30.53 
 
 
180 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  27.59 
 
 
180 aa  54.7  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  25.68 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  25.27 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  43.28 
 
 
90 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  26.22 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  30 
 
 
197 aa  51.6  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  35.92 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  30.86 
 
 
256 aa  48.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2275  carbonic anhydrase  29.75 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  26.26 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  30.94 
 
 
234 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  29.79 
 
 
245 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  29.03 
 
 
246 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  35.62 
 
 
224 aa  44.7  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  29.56 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1268  Carbonate dehydratase  31.52 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7207  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0779  carbonic anhydrase  25.84 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  27.61 
 
 
278 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  28.28 
 
 
109 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  27.44 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  28.8 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  29.68 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  28.11 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  25.75 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  30 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  25.45 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  28.89 
 
 
211 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  24.55 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  36.84 
 
 
213 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  25.82 
 
 
227 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  29.3 
 
 
180 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  36 
 
 
255 aa  41.2  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  28.43 
 
 
222 aa  41.2  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>