183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5906 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  100 
 
 
192 aa  383  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  64.42 
 
 
205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  53.66 
 
 
164 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  53.37 
 
 
174 aa  174  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  49.39 
 
 
163 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  50.61 
 
 
162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  51.53 
 
 
163 aa  171  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  52.12 
 
 
164 aa  171  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  52.76 
 
 
163 aa  167  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  55 
 
 
163 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  55 
 
 
163 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  55 
 
 
163 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  53.57 
 
 
163 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  53.57 
 
 
163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  51.8 
 
 
162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  51.09 
 
 
163 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  44.81 
 
 
181 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  51.11 
 
 
163 aa  151  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  48.47 
 
 
164 aa  147  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  42.94 
 
 
163 aa  144  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  45.52 
 
 
165 aa  132  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  44.83 
 
 
165 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  39.88 
 
 
165 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  41.1 
 
 
134 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  41.22 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  43.07 
 
 
162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  41.43 
 
 
141 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  36.53 
 
 
198 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  36.53 
 
 
197 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  38.65 
 
 
193 aa  107  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  41.61 
 
 
164 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  38.13 
 
 
165 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  37.27 
 
 
192 aa  104  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  35.39 
 
 
194 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  34.24 
 
 
193 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  33.74 
 
 
193 aa  99  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  36.22 
 
 
192 aa  98.6  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  35.46 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  38.46 
 
 
166 aa  95.5  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  40.6 
 
 
179 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  33.77 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  36.48 
 
 
189 aa  91.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  30.14 
 
 
150 aa  91.3  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  32.88 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  32.88 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  32.68 
 
 
157 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  32.88 
 
 
150 aa  89.4  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  38.52 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  33.77 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  36.3 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  28.81 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  40.3 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  30.97 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  29.3 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  28.03 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  27.68 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  28.57 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  31.13 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  31.79 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  30.46 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  30.46 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  30.46 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  30.46 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  30.46 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  30.46 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  30.46 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  27.56 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  30.46 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  28.65 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  25.84 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  32.02 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  28.66 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  27.87 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  30.51 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  30.13 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  32.37 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  54.39 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  30.39 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  31.28 
 
 
291 aa  62.4  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  36.23 
 
 
768 aa  54.7  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  36.23 
 
 
768 aa  54.7  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  27.22 
 
 
245 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4079  carbonic anhydrase  26.02 
 
 
236 aa  54.7  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  30.07 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  27.63 
 
 
234 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0779  carbonic anhydrase  31.08 
 
 
226 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1182  carbonic anhydrase  36.05 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0271788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  27.04 
 
 
278 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  34.48 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  25.42 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  29.17 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  29.48 
 
 
256 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3303  carbonic anhydrase  32.18 
 
 
243 aa  48.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.015811  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  28.71 
 
 
109 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  26.62 
 
 
246 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0526  carbonic anhydrase  26.49 
 
 
235 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1098  carbonic anhydrase  28.19 
 
 
245 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05180  carbonic anhydrase  31.71 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  21.79 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  27.27 
 
 
234 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>