122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0414 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  100 
 
 
190 aa  387  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  94.62 
 
 
186 aa  363  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  62.09 
 
 
185 aa  248  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  61.29 
 
 
187 aa  246  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  60.75 
 
 
187 aa  246  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  60.75 
 
 
187 aa  245  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  60.75 
 
 
187 aa  245  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  60.75 
 
 
187 aa  245  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  60.75 
 
 
187 aa  245  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  60.75 
 
 
187 aa  245  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  60.75 
 
 
187 aa  245  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  60.75 
 
 
187 aa  245  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  60.75 
 
 
187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  60.75 
 
 
187 aa  232  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  58.66 
 
 
180 aa  224  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  52.72 
 
 
193 aa  218  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  51.63 
 
 
193 aa  214  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  51.69 
 
 
190 aa  192  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  41.08 
 
 
180 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  40.66 
 
 
180 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  40.44 
 
 
192 aa  156  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  40.66 
 
 
180 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  40.98 
 
 
181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  40.98 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  41.06 
 
 
157 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  41.72 
 
 
150 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  41.06 
 
 
150 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  40.76 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  40.4 
 
 
150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  39.74 
 
 
150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  28.26 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  28.26 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1108  carbonic anhydrase  29.45 
 
 
166 aa  88.2  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  27.72 
 
 
180 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2936  carbonic anhydrase  33.12 
 
 
170 aa  85.5  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3196  carbonate dehydratase  35.33 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2957  hypothetical protein  33.12 
 
 
170 aa  84.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3181  hypothetical protein  33.12 
 
 
170 aa  84.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.58112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  25.71 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  24.6 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  31.43 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  27.23 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  28.42 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3174  carbonate dehydratase  30.57 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  26.97 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  28.74 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3189  hypothetical protein  29.49 
 
 
173 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.326929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  28.34 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  25.82 
 
 
165 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  28.57 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  29.32 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  27.39 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2074  hypothetical protein  30.57 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2872  carbonic anhydrase  33.77 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  27.56 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  26.7 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  27.42 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  24.58 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  31.48 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  24.04 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  28.34 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  27.37 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  26.32 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  26.06 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  26.06 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  26.06 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  24.16 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  24.57 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  23.75 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  25.45 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  25.41 
 
 
166 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  24.31 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  25.56 
 
 
164 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  22.47 
 
 
163 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  25.47 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  23.95 
 
 
163 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  26 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  24.74 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3188  hypothetical protein  33.94 
 
 
120 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  23.03 
 
 
163 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  22.67 
 
 
162 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  24.58 
 
 
181 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  22.67 
 
 
164 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  24.73 
 
 
166 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  20.75 
 
 
163 aa  57.8  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  22.29 
 
 
163 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  21.33 
 
 
163 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  25.68 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  25.36 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  25.13 
 
 
211 aa  48.5  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  32.04 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  26.67 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  25 
 
 
234 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  26.02 
 
 
211 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  23.2 
 
 
225 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2001  carbonate dehydratase  23.56 
 
 
199 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  22.77 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  25.68 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  21.51 
 
 
230 aa  44.7  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  25 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>