134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2952 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  100 
 
 
166 aa  332  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  50.62 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  53.85 
 
 
167 aa  160  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  53.46 
 
 
164 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  51.92 
 
 
179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  48.45 
 
 
179 aa  141  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  44.38 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  35.8 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  34.43 
 
 
197 aa  111  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  39.24 
 
 
165 aa  106  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  33.9 
 
 
192 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  36.81 
 
 
165 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  32.6 
 
 
192 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  35.39 
 
 
193 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  36.72 
 
 
193 aa  104  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  33.95 
 
 
174 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  35.8 
 
 
165 aa  103  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  34.64 
 
 
198 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  34.25 
 
 
194 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  36.02 
 
 
163 aa  98.2  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
193 aa  97.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  41.04 
 
 
141 aa  97.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  39.85 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  32.3 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  38.85 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  30.67 
 
 
165 aa  92.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  37.04 
 
 
189 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  30 
 
 
181 aa  88.6  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  30.19 
 
 
163 aa  88.2  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  32.88 
 
 
150 aa  87.4  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  32.1 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  31.25 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  30.82 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  31.51 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  29.83 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  33.58 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  30.19 
 
 
163 aa  84  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  30.19 
 
 
163 aa  84  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  30.19 
 
 
163 aa  84  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  34.56 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  32.89 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  31.93 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  32.84 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  30.41 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  32.59 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  29.38 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  29.05 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  29.05 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  32.14 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  28.75 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  28.73 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  31.46 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  28.11 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  29.28 
 
 
193 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  28.74 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  29.61 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  29.34 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  29.34 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  43.59 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  29.34 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  29.35 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  30.34 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  28.81 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  27.12 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  32.2 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  28.31 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  29.38 
 
 
197 aa  62  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  31.13 
 
 
182 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.27 
 
 
187 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  27.65 
 
 
184 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  25 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  25 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  25 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  25 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  25 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  24.18 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  24.73 
 
 
190 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  28.57 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  29.22 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  28.83 
 
 
210 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  43.86 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  30.27 
 
 
242 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  34.74 
 
 
256 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  28.41 
 
 
245 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  27.92 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  24.68 
 
 
213 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  26.54 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0840  carbonic anhydrase  26.49 
 
 
230 aa  48.5  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0252218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  32.29 
 
 
234 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  27.41 
 
 
220 aa  48.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000488965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2696  carbonic anhydrase  26.35 
 
 
272 aa  47.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  22.1 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  22.1 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  29.25 
 
 
239 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3056  Carbonate dehydratase  23.47 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  26.42 
 
 
211 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5990  carbonate dehydratase  24.56 
 
 
220 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000572555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>