61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4023 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  100 
 
 
134 aa  273  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  56.44 
 
 
164 aa  174  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  54.94 
 
 
163 aa  166  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  53.09 
 
 
162 aa  163  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  53.37 
 
 
162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  55.56 
 
 
164 aa  159  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  50 
 
 
174 aa  157  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  51.23 
 
 
163 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  51.23 
 
 
163 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  51.23 
 
 
163 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  51.23 
 
 
163 aa  150  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  50 
 
 
163 aa  150  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  50.62 
 
 
163 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  47.53 
 
 
163 aa  141  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  42.59 
 
 
163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  41.82 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  36.42 
 
 
163 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  41.73 
 
 
163 aa  116  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  42.45 
 
 
192 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  37.65 
 
 
181 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  38.27 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  38.97 
 
 
164 aa  90.1  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  31.9 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  38.24 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  34.42 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  34.04 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  30.17 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  28.12 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  28.98 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  29.94 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  30.56 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  25 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  27.75 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  31.1 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  26.97 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  27.53 
 
 
192 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  27.07 
 
 
197 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  31.08 
 
 
180 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  26.75 
 
 
179 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  27.27 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  25.15 
 
 
180 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  29.73 
 
 
180 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  28.38 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  27.4 
 
 
181 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  28.95 
 
 
197 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  26.54 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  27.78 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  26.57 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  28.57 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  31 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  25 
 
 
150 aa  47  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  26.03 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  27.04 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  32.22 
 
 
180 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  33.71 
 
 
180 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  32.22 
 
 
180 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  31.87 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  24.29 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  26.28 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  23.57 
 
 
150 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  23.97 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>