63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2035 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  100 
 
 		 90 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  79.78 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  85 
 
 		 194 aa  140  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  80.25 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  81.01 
 
 		 193 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  82.28 
 
 		 193 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  82.28 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  78.75 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  80.77 
 
 		 192 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  68.42 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  57.83 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  57.5 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  57.5 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  57.5 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  56.79 
 
 		 163 aa  94  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  59.76 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  54.32 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  56.25 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  56.25 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  56.79 
 
 		 164 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  58.02 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  55 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  56.25 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  54.32 
 
 		 162 aa  84.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  52.44 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  51.22 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  69.49 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  53.25 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  48.75 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  45.57 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  44.05 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  45.12 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  53.09 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  42.35 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  55.17 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  42.68 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  42.68 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  43.59 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  54.39 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  43.59 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  37.18 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  49.21 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  46.88 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  45.9 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  48.28 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  47.46 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  47.46 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  43.68 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  45.76 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  43.68 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  42.05 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  43.28 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  39.77 
 
 		 181 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  42.22 
 
 		 197 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  45.45 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  35.9 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  39.33 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  37.1 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  38.71 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  32.58 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  35.11 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  37.66 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  34.04 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>