216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1887 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  97.78 
 
 		 180 aa  358  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  78.89 
 
 		 180 aa  310  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  78.45 
 
 		 192 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  77.9 
 
 		 181 aa  305  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  75.56 
 
 		 197 aa  283  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  40.54 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  41.08 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  41.08 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  41.08 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  41.08 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  41.08 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  41.08 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  41.08 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  41.08 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  41.08 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  40.66 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  41.62 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  41.08 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  48.98 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  48.98 
 
 		 150 aa  147  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  49.32 
 
 		 150 aa  147  9e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  41.11 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  49.66 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  48.3 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  38.04 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  44.17 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  40.22 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  40.22 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  37.5 
 
 		 180 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  36.98 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  36.98 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  39.66 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  36.52 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  38.25 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  32.97 
 
 		 291 aa  98.6  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  36.02 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  40.91 
 
 		 141 aa  95.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  35.64 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  34.59 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  33.9 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  36.42 
 
 		 167 aa  91.7  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  33.91 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  33.52 
 
 		 163 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  35.45 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  33.52 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  33.15 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  33.9 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  35.33 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  33.71 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  34.95 
 
 		 193 aa  87.8  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  31.58 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  34.1 
 
 		 165 aa  87.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  31.84 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  33.88 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  33.52 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  30.46 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  32.97 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  29.71 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  29.49 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  32.54 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  35.17 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  27.37 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  29.21 
 
 		 163 aa  72  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  31.18 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  30.43 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  27.5 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2936  carbonic anhydrase  25.97 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  29.28 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  27.47 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  31.46 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2957  hypothetical protein  25.49 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3181  hypothetical protein  25.49 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.58112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3174  carbonate dehydratase  27.97 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1108  carbonic anhydrase  28.03 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3196  carbonate dehydratase  24.82 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3189  hypothetical protein  24.11 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.326929  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  29.82 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2074  hypothetical protein  27.78 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  30.53 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  43.68 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3188  hypothetical protein  28.7 
 
 		 120 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  29.73 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  24.37 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  24.63 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  24.51 
 
 		 218 aa  52  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2872  carbonic anhydrase  24.18 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  27.08 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  39.29 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  26.15 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  38.95 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  22.64 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  32.35 
 
 		 229 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  37.11 
 
 		 242 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>