118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1529 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  100 
 
 		 193 aa  400  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  73.82 
 
 		 193 aa  310  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  72.54 
 
 		 192 aa  308  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  73.96 
 
 		 194 aa  301  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  65.28 
 
 		 198 aa  287  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  67.2 
 
 		 192 aa  281  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  65.79 
 
 		 193 aa  278  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  66.15 
 
 		 197 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  45.86 
 
 		 165 aa  157  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  47.75 
 
 		 162 aa  153  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  46.88 
 
 		 141 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  41.11 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  43.35 
 
 		 164 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  40.98 
 
 		 165 aa  138  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  78.75 
 
 		 90 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  39.56 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  39.56 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  39.56 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  39.08 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  40.56 
 
 		 163 aa  131  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  39.78 
 
 		 174 aa  131  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  40.56 
 
 		 163 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  38.46 
 
 		 164 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  51.4 
 
 		 109 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  37.91 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  37.78 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  39.01 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  37.91 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  39.53 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  37.91 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  34.97 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  35 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  32.96 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  32.79 
 
 		 166 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  35.14 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  33.15 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  30.56 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  35.98 
 
 		 163 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  36.42 
 
 		 163 aa  99.4  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  33.74 
 
 		 192 aa  98.2  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 166 aa  97.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  41.35 
 
 		 164 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  36.08 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  33.94 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  35.87 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  36.75 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  34.81 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  36.71 
 
 		 150 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  35.33 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  35.44 
 
 		 150 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  36.77 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  31.18 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  34.95 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  36.08 
 
 		 157 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  33.51 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  31.64 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  31.63 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  32.08 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  30.77 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  30.53 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  30 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  29.89 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  29.44 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  29.38 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  27.75 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  29.09 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  24.08 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  27.39 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  24.74 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  26.75 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  25.79 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  25.79 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  25.79 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  25.79 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  25.79 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.79 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.79 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.79 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  27.71 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  27.67 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  25.16 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  25.16 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  25.16 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  27.32 
 
 		 246 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  27.33 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  22.22 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  25.82 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2698  carbonic anhydrase  31.25 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  37.1 
 
 		 256 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  35.05 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  31.63 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2454  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 225 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  30.7 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  34.25 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2275  carbonic anhydrase  39.34 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0990  twin-arginine translocation pathway signal  45.59 
 
 		 243 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0151815  normal  0.34063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0800  carbonic anhydrase  43.55 
 
 		 221 aa  44.7  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000181873  normal  0.299491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  37.1 
 
 		 234 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1090  carbonic anhydrase  30.95 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  26.92 
 
 		 239 aa  44.7  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>