More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2753 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  100 
 
 		 236 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  71.91 
 
 		 234 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  69.79 
 
 		 234 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0867  carbonic anhydrase  74.23 
 
 		 235 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0728812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  60.68 
 
 		 234 aa  258  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  62.11 
 
 		 256 aa  244  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  53.97 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  53.28 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  50.41 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  53.43 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2668  carbonic anhydrase  56.78 
 
 		 245 aa  210  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4079  carbonic anhydrase  46.81 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1098  carbonic anhydrase  45.12 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4248  carbonic anhydrase  45.73 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4310  carbonic anhydrase  45.73 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000873696  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0991  twin-arginine translocation pathway signal  47.37 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0388173  normal  0.219389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4062  carbonic anhydrase  43.72 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54316  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0990  twin-arginine translocation pathway signal  42.36 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0151815  normal  0.34063 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1700  carbonic anhydrase  47.47 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3696  carbonic anhydrase  48.19 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2454  carbonic anhydrase  50.26 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117337  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2569  hypothetical protein  38.02 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2423  hypothetical protein  38.74 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2696  carbonic anhydrase  48.73 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1994  carbonic anhydrase  40.87 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00658745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2939  carbonic anhydrase  41.28 
 
 		 269 aa  151  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10436e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0240  carbonic anhydrase  41.43 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0948086  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0217  carbonic anhydrase  43.22 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0194382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1737  carbonic anhydrase  41.38 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20500  carbonic anhydrase  43.46 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196424  normal  0.646859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0800  carbonic anhydrase  40.2 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000181873  normal  0.299491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3323  carbonic anhydrase  43.27 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2143  hypothetical protein  38.12 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0361  carbonic anhydrase  40.51 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.738606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1442  carbonic anhydrase family protein  40.08 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0231091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3684  carbonic anhydrase  42.29 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000316532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3601  carbonic anhydrase  41.6 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0405  carbonic anhydrase  41.58 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.0139247 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2396  carbonic anhydrase  41.97 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4065  carbonic anhydrase  45.26 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2193  carbonic anhydrase  37.39 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0405981  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2118  hypothetical protein  37.62 
 
 		 208 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2979  carbonic anhydrase-like  43.07 
 
 		 399 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3600  carbonic anhydrase  46.99 
 
 		 212 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672815  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10408  Carbonic anhydrase  42.56 
 
 		 188 aa  141  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.477644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2488  carbonic anhydrase  39.82 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000357075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1171  carbonic anhydrase family protein  37.39 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1242  carbonic anhydrase  41.29 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1487  carbonic anhydrase  41.67 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0301  carbonic anhydrase  39.7 
 
 		 325 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000471687  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0526  carbonic anhydrase  37.5 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1253  carbonic anhydrase  39.8 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175923 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0878  carbonic anhydrase  41.8 
 
 		 257 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13621  carbonic anhydrase  43.22 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.80194e-33  normal  0.0391144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3958  carbonic anhydrase  41.45 
 
 		 250 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0066  carbonic anhydrase  42.16 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0936  carbonic anhydrase  38.97 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1340  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3303  carbonic anhydrase  42 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.015811  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0010  Mig5  34.21 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1607  carbonic anhydrase  40.71 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1911  carbonic anhydrase  39.71 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0884493  normal  0.586468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1182  carbonic anhydrase  39.69 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0271788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3139  carbonic anhydrase  41.12 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5345  carbonic anhydrase  43.94 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6116  carbonic anhydrase  38.78 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5131  carbonic anhydrase  41.12 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4831  carbonic anhydrase  41.12 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0634  carbonic anhydrase  37.56 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1001  carbonic anhydrase  35.35 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.936543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4087  carbonic anhydrase  41.75 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00019736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0950  putative carbonic anhydrase  36.36 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.430149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3272  putative carbonic anhydrase  36.36 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  hitchhiker  0.000000000568785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4745  carbonic anhydrase  41.45 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0964  carbonic anhydrase  40.3 
 
 		 216 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0890219  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0596  carbonic anhydrase  38.86 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179386  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4468  carbonic anhydrase  38.62 
 
 		 246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.873511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4100  carbonic anhydrase  38.62 
 
 		 246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325478 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3786  carbonic anhydrase  34.3 
 
 		 248 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0779  carbonic anhydrase  36.59 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  34.52 
 
 		 768 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  34.52 
 
 		 768 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05180  carbonic anhydrase  38.95 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1439  carbonic anhydrase  42.93 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932931  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1148  carbonic anhydrase  36.82 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26460  carbonic anhydrase  38.12 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.310613 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1011  carbonic anhydrase  31.71 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.956066 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3139  carbonic anhydrase  37.75 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0743  carbonic anhydrase  36.5 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.576778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0530  carbonic anhydrase  39.47 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0442  carbonic anhydrase  42.41 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1094  carbonic anhydrase  37.8 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0137152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1408  carbonic anhydrase  32.14 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2275  carbonic anhydrase  32.38 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0965  carbonic anhydrase  36.71 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2647  twin-arginine translocation pathway signal  30.17 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31420  carbonic anhydrase  33.81 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 214 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  33.16 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  34 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>