More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7305 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  57.55 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  55.28 
 
 		 242 aa  264  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  65.45 
 
 		 239 aa  262  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  59.15 
 
 		 234 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  64.97 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2668  carbonic anhydrase  57.98 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  63.21 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  63.83 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  52.82 
 
 		 256 aa  238  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0867  carbonic anhydrase  60.1 
 
 		 235 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0728812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0991  twin-arginine translocation pathway signal  46.7 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0388173  normal  0.219389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4079  carbonic anhydrase  41.22 
 
 		 236 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0990  twin-arginine translocation pathway signal  42.38 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0151815  normal  0.34063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1098  carbonic anhydrase  40.5 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2454  carbonic anhydrase  47.15 
 
 		 225 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3601  carbonic anhydrase  40.85 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1994  carbonic anhydrase  41.31 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00658745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1340  carbonic anhydrase  39.66 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0066  carbonic anhydrase  46.19 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3684  carbonic anhydrase  44.06 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000316532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2396  carbonic anhydrase  42.71 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3303  carbonic anhydrase  42.64 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.015811  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1242  carbonic anhydrase  43.72 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2488  carbonic anhydrase  41.95 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000357075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4062  carbonic anhydrase  39.39 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54316  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2569  hypothetical protein  35.45 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2423  hypothetical protein  35.45 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0800  carbonic anhydrase  41.21 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000181873  normal  0.299491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4310  carbonic anhydrase  36.02 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000873696  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1737  carbonic anhydrase  35.81 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4248  carbonic anhydrase  36.02 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2696  carbonic anhydrase  44.1 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1253  carbonic anhydrase  40 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175923 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2143  hypothetical protein  37.5 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1700  carbonic anhydrase  42.42 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1171  carbonic anhydrase family protein  38.94 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2118  hypothetical protein  37 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1182  carbonic anhydrase  40.82 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0271788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3600  carbonic anhydrase  43.72 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672815  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2193  carbonic anhydrase  39.9 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0405981  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0301  carbonic anhydrase  39 
 
 		 325 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000471687  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0526  carbonic anhydrase  38.69 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0361  carbonic anhydrase  39.7 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.738606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1442  carbonic anhydrase family protein  37.83 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0231091  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3696  carbonic anhydrase  40.4 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3323  carbonic anhydrase  41.95 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0010  Mig5  38.38 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2939  carbonic anhydrase  37.27 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10436e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3272  putative carbonic anhydrase  37.37 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  hitchhiker  0.000000000568785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1001  carbonic anhydrase  37.37 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.936543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0950  putative carbonic anhydrase  37.37 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.430149  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20500  carbonic anhydrase  37.63 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196424  normal  0.646859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0596  carbonic anhydrase  36.27 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4087  carbonic anhydrase  40.1 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00019736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0743  carbonic anhydrase  37.93 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.576778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1487  carbonic anhydrase  40 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2979  carbonic anhydrase-like  37.62 
 
 		 399 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3958  carbonic anhydrase  38.19 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0405  carbonic anhydrase  36.32 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.0139247 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10408  Carbonic anhydrase  39.49 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.477644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  35.35 
 
 		 768 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  35.35 
 
 		 768 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1148  carbonic anhydrase  38.68 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1607  carbonic anhydrase  36.91 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0936  carbonic anhydrase  37.28 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3139  carbonic anhydrase  40 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0964  carbonic anhydrase  37.88 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0890219  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05180  carbonic anhydrase  38.74 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4065  carbonic anhydrase  35.9 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1911  carbonic anhydrase  35.32 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0884493  normal  0.586468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0878  carbonic anhydrase  38.58 
 
 		 257 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0240  carbonic anhydrase  37.19 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0948086  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0634  carbonic anhydrase  35.96 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3139  carbonic anhydrase  38.68 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0779  carbonic anhydrase  34.15 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0217  carbonic anhydrase  35.86 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0194382 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2275  carbonic anhydrase  35.27 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5345  carbonic anhydrase  36.27 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13621  carbonic anhydrase  38.14 
 
 		 207 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.80194e-33  normal  0.0391144 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6116  carbonic anhydrase  39.3 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1094  carbonic anhydrase  34.76 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0137152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4831  carbonic anhydrase  33.68 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5131  carbonic anhydrase  33.68 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0530  carbonic anhydrase  38.78 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0442  carbonic anhydrase  40.91 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3786  carbonic anhydrase  31.78 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2647  twin-arginine translocation pathway signal  33.47 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4745  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 200 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0965  carbonic anhydrase  35.96 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1408  carbonic anhydrase  34.26 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26460  carbonic anhydrase  36.45 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.310613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4468  carbonic anhydrase  38.4 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.873511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4100  carbonic anhydrase  38.4 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325478 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1011  carbonic anhydrase  35.96 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.956066 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  34.52 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31420  carbonic anhydrase  35.53 
 
 		 220 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1439  carbonic anhydrase  36.27 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932931  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2345  carbonic anhydrase  36.07 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  30.35 
 
 		 272 aa  92  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>