More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2488 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2488  carbonic anhydrase  100 
 
 
235 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000357075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1994  carbonic anhydrase  65.25 
 
 
234 aa  298  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00658745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1242  carbonic anhydrase  65.17 
 
 
233 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1442  carbonic anhydrase family protein  67.34 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1148  carbonic anhydrase  60.85 
 
 
230 aa  261  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3139  carbonic anhydrase  58.72 
 
 
230 aa  241  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3684  carbonic anhydrase  54.41 
 
 
232 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000316532  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1171  carbonic anhydrase family protein  50.73 
 
 
240 aa  194  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1737  carbonic anhydrase  47.37 
 
 
252 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2454  carbonic anhydrase  48.74 
 
 
225 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117337  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4062  carbonic anhydrase  40.72 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54316  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2696  carbonic anhydrase  41.51 
 
 
272 aa  158  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3323  carbonic anhydrase  43.28 
 
 
243 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1700  carbonic anhydrase  41.71 
 
 
237 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3139  carbonic anhydrase  39.73 
 
 
217 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213297  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3601  carbonic anhydrase  43 
 
 
238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1607  carbonic anhydrase  36.86 
 
 
244 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  41.95 
 
 
234 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1487  carbonic anhydrase  42.72 
 
 
247 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1098  carbonic anhydrase  43 
 
 
245 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10408  Carbonic anhydrase  41.21 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.477644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2396  carbonic anhydrase  39.46 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2143  hypothetical protein  37.86 
 
 
208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0405  carbonic anhydrase  40.76 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.0139247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3303  carbonic anhydrase  42.05 
 
 
243 aa  145  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.015811  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2118  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1340  carbonic anhydrase  36.92 
 
 
258 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0990  twin-arginine translocation pathway signal  38.38 
 
 
243 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0151815  normal  0.34063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0066  carbonic anhydrase  43.78 
 
 
275 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0240  carbonic anhydrase  42.16 
 
 
212 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0948086  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0867  carbonic anhydrase  41.92 
 
 
235 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0728812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4079  carbonic anhydrase  42.35 
 
 
236 aa  142  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4310  carbonic anhydrase  37.75 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000873696  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0217  carbonic anhydrase  42.29 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0194382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4248  carbonic anhydrase  37.75 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0991  twin-arginine translocation pathway signal  39.5 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0388173  normal  0.219389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  38.78 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  39.81 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0526  carbonic anhydrase  35.71 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212922 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3272  putative carbonic anhydrase  35.07 
 
 
225 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  hitchhiker  0.000000000568785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0950  putative carbonic anhydrase  35.07 
 
 
225 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.430149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  39.52 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1001  carbonic anhydrase  35.07 
 
 
251 aa  138  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.936543  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  37.93 
 
 
768 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  39.07 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3696  carbonic anhydrase  38.27 
 
 
251 aa  135  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4065  carbonic anhydrase  39.5 
 
 
232 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  37.44 
 
 
768 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  38.81 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2569  hypothetical protein  37.02 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2423  hypothetical protein  37.02 
 
 
245 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0010  Mig5  35.83 
 
 
246 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0743  carbonic anhydrase  38.54 
 
 
210 aa  132  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.576778  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0596  carbonic anhydrase  38.89 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179386  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6116  carbonic anhydrase  38.03 
 
 
246 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445243  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2668  carbonic anhydrase  38.68 
 
 
245 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1253  carbonic anhydrase  36.76 
 
 
204 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  40.72 
 
 
236 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4087  carbonic anhydrase  36.18 
 
 
216 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00019736  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20500  carbonic anhydrase  34.98 
 
 
204 aa  128  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196424  normal  0.646859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0530  carbonic anhydrase  39.29 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0301  carbonic anhydrase  34.93 
 
 
325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000471687  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1182  carbonic anhydrase  35.68 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0271788  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1408  carbonic anhydrase  33.93 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0361  carbonic anhydrase  34.01 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.738606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0964  carbonic anhydrase  36.89 
 
 
216 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0890219  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0800  carbonic anhydrase  36.82 
 
 
221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000181873  normal  0.299491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  36.14 
 
 
246 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0634  carbonic anhydrase  36.27 
 
 
238 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1094  carbonic anhydrase  36.87 
 
 
236 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0137152  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2939  carbonic anhydrase  37.99 
 
 
269 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10436e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1911  carbonic anhydrase  47.54 
 
 
203 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0884493  normal  0.586468 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1011  carbonic anhydrase  35.21 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.956066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0779  carbonic anhydrase  34.76 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13621  carbonic anhydrase  38.78 
 
 
207 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.80194e-33  normal  0.0391144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2979  carbonic anhydrase-like  36.74 
 
 
399 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0442  carbonic anhydrase  43.05 
 
 
236 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4100  carbonic anhydrase  40 
 
 
246 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4468  carbonic anhydrase  40 
 
 
246 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.873511  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0017  carbonate dehydratase  32.86 
 
 
219 aa  118  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361281 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2193  carbonic anhydrase  32.66 
 
 
239 aa  118  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0405981  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2647  twin-arginine translocation pathway signal  34.33 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05180  carbonic anhydrase  36.55 
 
 
223 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0878  carbonic anhydrase  38.42 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0965  carbonic anhydrase  37.07 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0936  carbonic anhydrase  36.76 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2275  carbonic anhydrase  33.62 
 
 
231 aa  115  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5345  carbonic anhydrase  38.07 
 
 
206 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26460  carbonic anhydrase  36.71 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.310613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5131  carbonic anhydrase  36.68 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4831  carbonic anhydrase  36.68 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3600  carbonic anhydrase  36.98 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672815  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4745  carbonic anhydrase  36.92 
 
 
200 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2345  carbonic anhydrase  36.7 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3786  carbonic anhydrase  32.23 
 
 
248 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  34 
 
 
256 aa  108  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3958  carbonic anhydrase  32.38 
 
 
250 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1439  carbonic anhydrase  38.73 
 
 
206 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932931  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31420  carbonic anhydrase  31.71 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09780  carbonic anhydrase  43.44 
 
 
284 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.550137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>