More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2668 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2668  carbonic anhydrase  100 
 
 
245 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  58.16 
 
 
234 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  59.02 
 
 
246 aa  250  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  52.24 
 
 
245 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  53.06 
 
 
242 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  50.22 
 
 
234 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0867  carbonic anhydrase  54.4 
 
 
235 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0728812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  56.12 
 
 
239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  56.91 
 
 
236 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  48.73 
 
 
234 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  52.88 
 
 
256 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0990  twin-arginine translocation pathway signal  41.91 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0151815  normal  0.34063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1098  carbonic anhydrase  38.59 
 
 
245 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2569  hypothetical protein  37.39 
 
 
246 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2423  hypothetical protein  37.8 
 
 
245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2396  carbonic anhydrase  41.35 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0991  twin-arginine translocation pathway signal  41.71 
 
 
244 aa  151  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0388173  normal  0.219389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3303  carbonic anhydrase  46.73 
 
 
243 aa  151  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.015811  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2696  carbonic anhydrase  43.15 
 
 
272 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4079  carbonic anhydrase  39.41 
 
 
236 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2143  hypothetical protein  35.41 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3684  carbonic anhydrase  43.07 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000316532  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1171  carbonic anhydrase family protein  39.13 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0361  carbonic anhydrase  38.49 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.738606  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4310  carbonic anhydrase  37.29 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000873696  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4248  carbonic anhydrase  37.29 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0066  carbonic anhydrase  44.39 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0526  carbonic anhydrase  35.24 
 
 
235 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212922 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2118  hypothetical protein  34.93 
 
 
208 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4062  carbonic anhydrase  36.86 
 
 
233 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54316  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0301  carbonic anhydrase  41.26 
 
 
325 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000471687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3601  carbonic anhydrase  37.34 
 
 
238 aa  141  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2939  carbonic anhydrase  40.98 
 
 
269 aa  141  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10436e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0596  carbonic anhydrase  40.41 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1340  carbonic anhydrase  38.03 
 
 
258 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2488  carbonic anhydrase  38.46 
 
 
235 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000357075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2454  carbonic anhydrase  41.71 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117337  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0405  carbonic anhydrase  41.18 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.0139247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3600  carbonic anhydrase  42.93 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1994  carbonic anhydrase  38.16 
 
 
234 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00658745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1737  carbonic anhydrase  38.62 
 
 
252 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1182  carbonic anhydrase  39.06 
 
 
204 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0271788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1253  carbonic anhydrase  38.22 
 
 
204 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175923 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20500  carbonic anhydrase  39.09 
 
 
204 aa  134  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196424  normal  0.646859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3958  carbonic anhydrase  38.42 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2193  carbonic anhydrase  37.61 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0405981  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1242  carbonic anhydrase  39 
 
 
233 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0743  carbonic anhydrase  37.88 
 
 
210 aa  132  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.576778  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1700  carbonic anhydrase  39.2 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1001  carbonic anhydrase  32.26 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.936543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0779  carbonic anhydrase  36.84 
 
 
226 aa  131  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0950  putative carbonic anhydrase  32.54 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.430149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3272  putative carbonic anhydrase  32.54 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  hitchhiker  0.000000000568785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0800  carbonic anhydrase  35 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000181873  normal  0.299491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3696  carbonic anhydrase  39.58 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1607  carbonic anhydrase  36.51 
 
 
244 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3323  carbonic anhydrase  37.61 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0010  Mig5  33.49 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0964  carbonic anhydrase  38.27 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0890219  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05180  carbonic anhydrase  39.9 
 
 
223 aa  128  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4087  carbonic anhydrase  42.35 
 
 
216 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00019736  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0634  carbonic anhydrase  39.7 
 
 
238 aa  128  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0217  carbonic anhydrase  38.38 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0194382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0240  carbonic anhydrase  38.12 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0948086  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1094  carbonic anhydrase  37.2 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0137152  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  34.67 
 
 
768 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  34.67 
 
 
768 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10408  Carbonic anhydrase  36.55 
 
 
188 aa  126  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.477644  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0878  carbonic anhydrase  39.41 
 
 
257 aa  125  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3786  carbonic anhydrase  34.13 
 
 
248 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13621  carbonic anhydrase  40.1 
 
 
207 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.80194e-33  normal  0.0391144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0936  carbonic anhydrase  38.38 
 
 
244 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2979  carbonic anhydrase-like  36.14 
 
 
399 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1487  carbonic anhydrase  37.5 
 
 
247 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5345  carbonic anhydrase  37.31 
 
 
206 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2647  twin-arginine translocation pathway signal  40.46 
 
 
232 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0530  carbonic anhydrase  42.49 
 
 
246 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0442  carbonic anhydrase  45.33 
 
 
236 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0965  carbonic anhydrase  38.12 
 
 
230 aa  118  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2275  carbonic anhydrase  34.29 
 
 
231 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5131  carbonic anhydrase  35.2 
 
 
206 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4831  carbonic anhydrase  35.2 
 
 
206 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1442  carbonic anhydrase family protein  36.32 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0231091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26460  carbonic anhydrase  37.37 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.310613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4745  carbonic anhydrase  35.42 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6116  carbonic anhydrase  36.48 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445243  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3139  carbonic anhydrase  35.32 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213297  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1148  carbonic anhydrase  34.52 
 
 
230 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1911  carbonic anhydrase  35.58 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0884493  normal  0.586468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4065  carbonic anhydrase  37.1 
 
 
232 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1011  carbonic anhydrase  32.52 
 
 
215 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.956066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1439  carbonic anhydrase  38.34 
 
 
206 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932931  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3139  carbonic anhydrase  34.52 
 
 
230 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31420  carbonic anhydrase  37.07 
 
 
220 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1408  carbonic anhydrase  31.56 
 
 
227 aa  104  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4100  carbonic anhydrase  38.89 
 
 
246 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4468  carbonic anhydrase  38.89 
 
 
246 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.873511  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2345  carbonic anhydrase  36.07 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  36.31 
 
 
217 aa  95.5  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  29.5 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.606633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>