132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2947 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  100 
 
 
164 aa  335  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  78.4 
 
 
163 aa  267  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  78.4 
 
 
163 aa  267  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  78.4 
 
 
163 aa  267  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  77.64 
 
 
163 aa  266  8.999999999999999e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  76.69 
 
 
163 aa  265  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  76.54 
 
 
163 aa  265  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  75.16 
 
 
162 aa  255  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  73.29 
 
 
162 aa  251  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  71.17 
 
 
163 aa  249  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  71.6 
 
 
163 aa  238  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  69.14 
 
 
174 aa  230  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  70.37 
 
 
164 aa  225  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  56.79 
 
 
163 aa  184  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  56.43 
 
 
192 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  47.53 
 
 
163 aa  168  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  53.29 
 
 
205 aa  166  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  51.55 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  47.53 
 
 
163 aa  163  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  48.5 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  49.69 
 
 
165 aa  159  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  55.56 
 
 
134 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  52.44 
 
 
165 aa  157  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  46.63 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  52.86 
 
 
141 aa  142  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  44.44 
 
 
165 aa  140  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  44.02 
 
 
193 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  43.65 
 
 
198 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  43.64 
 
 
165 aa  137  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  41.76 
 
 
192 aa  136  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  42.22 
 
 
193 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  41.67 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  39.23 
 
 
194 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  41.08 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  38.46 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  46.04 
 
 
165 aa  124  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  37.42 
 
 
164 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  36.94 
 
 
179 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  35.71 
 
 
189 aa  94  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  33.54 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  32.96 
 
 
180 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  56.25 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  35.86 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  33.33 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  32.6 
 
 
180 aa  87.8  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  32.41 
 
 
150 aa  87.4  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  35.42 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  32.7 
 
 
166 aa  87  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  35.8 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  30.82 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  34.48 
 
 
150 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  31.84 
 
 
180 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  33.1 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  32.96 
 
 
180 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  32.72 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  32.95 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  31.67 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  30.68 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  29.33 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  30 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  32.3 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  30.16 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  25.15 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  25.15 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  25.15 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  25.15 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  25.15 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.15 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.15 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.15 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.73 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  26 
 
 
187 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  28.98 
 
 
180 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  28.9 
 
 
193 aa  61.6  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  27.98 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  28.98 
 
 
180 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  27.33 
 
 
187 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  28.9 
 
 
193 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  22.67 
 
 
190 aa  58.2  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  22.52 
 
 
186 aa  58.2  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  32.77 
 
 
291 aa  58.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  27.15 
 
 
180 aa  57.4  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  29.14 
 
 
190 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  30.52 
 
 
180 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  28.19 
 
 
246 aa  54.3  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  27.33 
 
 
234 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2668  carbonic anhydrase  32.21 
 
 
245 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  27.92 
 
 
236 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  26.67 
 
 
256 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  25 
 
 
239 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  26 
 
 
234 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0867  carbonic anhydrase  27.43 
 
 
235 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0728812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  31.68 
 
 
109 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  30.34 
 
 
768 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  30.34 
 
 
768 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  23.56 
 
 
210 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  26.23 
 
 
219 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  27.63 
 
 
234 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  24.22 
 
 
217 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05611  carbonic anhydrase Nce103, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11250)  24.87 
 
 
212 aa  45.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0148146 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>