66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2034 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  100 
 
 		 109 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  78.1 
 
 		 197 aa  186  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  65.09 
 
 		 193 aa  143  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  58.88 
 
 		 198 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  55.14 
 
 		 192 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  51.4 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  54.29 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  53.85 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  55.24 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  39.6 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  39.6 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  38.78 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  31.31 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  33.67 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  35.35 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  30.69 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  31.31 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  31.13 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  30.61 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  43.86 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  30.69 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  30.69 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  30.69 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  28.71 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  31.63 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  28.85 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  31.31 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  30.3 
 
 		 163 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  46.81 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  31.68 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  29.36 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  31 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  43.18 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  29.59 
 
 		 187 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  31.58 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  29.59 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  29.59 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  29.59 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  29.59 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  29.59 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  29.59 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  29.59 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  29.59 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  27.72 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  29.59 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  28.57 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  30 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  27.55 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  39.58 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  28.43 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2698  carbonic anhydrase  45 
 
 		 212 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  26.67 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  30.36 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  28.16 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  28.57 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  28.71 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  37.5 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  28.28 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  26.53 
 
 		 205 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1090  carbonic anhydrase  43.24 
 
 		 198 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  25.49 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  25.71 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  29 
 
 		 180 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  26.26 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  25.74 
 
 		 150 aa  40  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  27.08 
 
 		 165 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>