163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3284 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  100 
 
 
163 aa  337  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  86.34 
 
 
163 aa  290  7e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  84.47 
 
 
163 aa  289  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  84.47 
 
 
163 aa  289  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  84.47 
 
 
163 aa  289  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  80.75 
 
 
163 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  79.01 
 
 
162 aa  275  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  77.64 
 
 
164 aa  266  8.999999999999999e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  74.53 
 
 
163 aa  261  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  75.16 
 
 
162 aa  258  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  71.95 
 
 
164 aa  241  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  72.22 
 
 
163 aa  237  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  63.41 
 
 
174 aa  216  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  55.83 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  49.69 
 
 
163 aa  177  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  52.17 
 
 
164 aa  173  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  48.15 
 
 
163 aa  168  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  54.68 
 
 
192 aa  168  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  56.62 
 
 
205 aa  167  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  46.63 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  49.7 
 
 
165 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  46.63 
 
 
165 aa  154  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  46.95 
 
 
162 aa  152  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  51.23 
 
 
134 aa  150  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  50.36 
 
 
141 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  42.31 
 
 
198 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  45.4 
 
 
165 aa  140  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  42.77 
 
 
165 aa  136  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  40.66 
 
 
193 aa  136  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  40.86 
 
 
192 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  40.11 
 
 
194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  40.98 
 
 
193 aa  134  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  39.89 
 
 
192 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  38.8 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  37.78 
 
 
193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  42.03 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  38.27 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  33.53 
 
 
179 aa  99  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  33.53 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  35.37 
 
 
150 aa  94.4  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  32.72 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  36.3 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  34.1 
 
 
189 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  33.95 
 
 
179 aa  90.9  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  34.46 
 
 
180 aa  90.5  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  36.54 
 
 
180 aa  90.5  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  56.25 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  33.79 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  34.93 
 
 
150 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  33.9 
 
 
180 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  30.19 
 
 
166 aa  88.2  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  34.25 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  36.5 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  33.52 
 
 
180 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  31.94 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  29.78 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  31.4 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  33.54 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  29.24 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  29.24 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  29.24 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  28.65 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  31.18 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  28.57 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  31.43 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  31.21 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  27.92 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  29.71 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  30 
 
 
184 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  26.62 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  27.27 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  27.27 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  27.27 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  27.27 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  27.27 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  27.27 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  27.27 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  27.27 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  28.49 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  27.27 
 
 
187 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  21.85 
 
 
186 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  21.33 
 
 
190 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  27.27 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  24.52 
 
 
246 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  28.98 
 
 
291 aa  54.3  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  28.71 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  25 
 
 
234 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1182  carbonic anhydrase  35.51 
 
 
204 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0271788  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  28.85 
 
 
245 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  24.5 
 
 
768 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  24.5 
 
 
768 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  24.05 
 
 
219 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  23.76 
 
 
217 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  25.64 
 
 
256 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  27.53 
 
 
193 aa  48.5  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  25.64 
 
 
234 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  25.81 
 
 
239 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  24.7 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2668  carbonic anhydrase  27.52 
 
 
245 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  22.91 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.24835 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>