205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1333 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  100 
 
 
165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  91.49 
 
 
141 aa  263  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  60.49 
 
 
162 aa  205  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  59.51 
 
 
165 aa  202  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  61.73 
 
 
165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  57.67 
 
 
165 aa  197  7e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  52.49 
 
 
192 aa  176  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  51.1 
 
 
198 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  49.73 
 
 
192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  49.44 
 
 
193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  49.46 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  52.44 
 
 
164 aa  157  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  45.86 
 
 
193 aa  157  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  48.62 
 
 
194 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  50 
 
 
163 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  51.53 
 
 
174 aa  155  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  50 
 
 
163 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  50 
 
 
163 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  49.7 
 
 
163 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  48.89 
 
 
193 aa  154  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  49.08 
 
 
164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  48.17 
 
 
163 aa  151  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  50.31 
 
 
162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  48.78 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  47.85 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  46.63 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  44.58 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  43.56 
 
 
164 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  42.94 
 
 
163 aa  131  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  39.64 
 
 
179 aa  120  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  41.61 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  43.29 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  39.39 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  36.71 
 
 
175 aa  111  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  41.43 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  43.06 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  40.78 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  37.35 
 
 
165 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  39.66 
 
 
180 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  36.81 
 
 
166 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  37.58 
 
 
166 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  35.67 
 
 
163 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  35.98 
 
 
181 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  38.55 
 
 
179 aa  101  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  38.27 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  37.43 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  40 
 
 
150 aa  95.1  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  42.75 
 
 
157 aa  94  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  34.08 
 
 
180 aa  94  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  59.76 
 
 
90 aa  94  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  35.56 
 
 
181 aa  91.3  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  34.48 
 
 
189 aa  91.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  35.96 
 
 
180 aa  90.9  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  34.44 
 
 
192 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  34.13 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  34.08 
 
 
197 aa  88.6  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  39.31 
 
 
172 aa  88.6  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  40.58 
 
 
150 aa  88.2  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  40.58 
 
 
150 aa  87.8  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  35.88 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  35.66 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  35.91 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  36.11 
 
 
193 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  29.1 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  27.81 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  25.82 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  28.11 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  28.11 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  28.11 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  28.11 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  28.11 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  28.11 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  28.11 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  28.11 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  26.09 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  28.26 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2698  carbonic anhydrase  30.73 
 
 
212 aa  73.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  34.09 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  27.72 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  39.6 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1090  carbonic anhydrase  36.61 
 
 
198 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  30.61 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  30.61 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  30.68 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  30.61 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  32.22 
 
 
291 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  27.53 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3696  carbonic anhydrase  32.64 
 
 
251 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  29.53 
 
 
245 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  31.36 
 
 
239 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  26.2 
 
 
234 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  25.13 
 
 
234 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  31.33 
 
 
246 aa  54.3  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0990  twin-arginine translocation pathway signal  43.59 
 
 
243 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0151815  normal  0.34063 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4079  carbonic anhydrase  26.59 
 
 
236 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2668  carbonic anhydrase  30.67 
 
 
245 aa  52  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  27.33 
 
 
207 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  28.11 
 
 
242 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  29.33 
 
 
768 aa  50.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  29.33 
 
 
768 aa  50.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>