177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2132 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  100 
 
 
167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  75.3 
 
 
175 aa  261  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  66.87 
 
 
164 aa  211  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  57.83 
 
 
166 aa  187  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  59.49 
 
 
179 aa  175  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  55 
 
 
179 aa  160  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  53.85 
 
 
166 aa  160  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  36.26 
 
 
192 aa  127  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  39.39 
 
 
165 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  34.97 
 
 
193 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  34.97 
 
 
193 aa  120  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  41.61 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  34.97 
 
 
198 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  33.88 
 
 
194 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  40.37 
 
 
165 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  36.61 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  40.61 
 
 
165 aa  115  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  36.26 
 
 
197 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  36.11 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  43.8 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  38.51 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  40 
 
 
162 aa  108  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  35.19 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  33.53 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  35.12 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  35.58 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  35.12 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  35.12 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  34.13 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  35.66 
 
 
150 aa  93.2  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  35.37 
 
 
163 aa  92  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  36.42 
 
 
180 aa  91.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  35.15 
 
 
162 aa  91.7  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  34.69 
 
 
172 aa  91.3  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  33.1 
 
 
150 aa  91.3  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  35.58 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  39.86 
 
 
189 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  36.2 
 
 
163 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  34.94 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  35.17 
 
 
150 aa  89  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  35.86 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  35.43 
 
 
180 aa  87.4  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  33.79 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  38.52 
 
 
192 aa  87.4  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  32.95 
 
 
197 aa  87  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  31.55 
 
 
163 aa  87  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
181 aa  85.5  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  32 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  34.86 
 
 
192 aa  84.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  35.58 
 
 
163 aa  84.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  27.43 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  32.02 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  35.56 
 
 
205 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  32.96 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  31.25 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  35.38 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  33.14 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  32.52 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  44.05 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  27.53 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  29.05 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  27.93 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  30 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  30 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  30 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  30 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  30 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  30 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  30 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  30 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  24.16 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  27.93 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  26.4 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  30.77 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  24.58 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  29.78 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  32.37 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  32.96 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  33.57 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  33.57 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  33.57 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  30.64 
 
 
291 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  30.22 
 
 
236 aa  54.3  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  36.36 
 
 
242 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  25.51 
 
 
256 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  38.82 
 
 
245 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0779  carbonic anhydrase  27.95 
 
 
226 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  32.1 
 
 
764 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  28.3 
 
 
211 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  35.11 
 
 
234 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  28.49 
 
 
207 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  26.99 
 
 
239 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  40.98 
 
 
246 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  46.81 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  27.63 
 
 
234 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  28.57 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  31.21 
 
 
726 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4079  carbonic anhydrase  28.32 
 
 
236 aa  48.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  26.42 
 
 
218 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>