136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1431 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  100 
 
 
194 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  77.49 
 
 
193 aa  314  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  79.17 
 
 
192 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  73.96 
 
 
193 aa  308  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  70 
 
 
193 aa  283  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  66.67 
 
 
198 aa  281  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  68.95 
 
 
192 aa  278  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  67.54 
 
 
197 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  47.7 
 
 
162 aa  156  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  48.07 
 
 
165 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  45.9 
 
 
165 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  48.75 
 
 
141 aa  143  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  85 
 
 
90 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  42.78 
 
 
165 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  41.57 
 
 
165 aa  139  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  41.76 
 
 
163 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  41.76 
 
 
163 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  41.76 
 
 
163 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  42.22 
 
 
164 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  40.11 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  41.21 
 
 
163 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  39.47 
 
 
174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  39.23 
 
 
164 aa  131  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  42.39 
 
 
163 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  40.66 
 
 
163 aa  130  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  41.44 
 
 
163 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  40 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  55.24 
 
 
109 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  36.57 
 
 
179 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  38.89 
 
 
162 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  37.08 
 
 
164 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  33.88 
 
 
167 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  39.44 
 
 
163 aa  111  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  37.3 
 
 
165 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  37.42 
 
 
163 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  35.84 
 
 
192 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  37.5 
 
 
150 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  33.89 
 
 
179 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  33.15 
 
 
166 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  38.38 
 
 
180 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  35.71 
 
 
150 aa  101  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  36.31 
 
 
163 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  31.82 
 
 
175 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  37.84 
 
 
180 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  34.52 
 
 
150 aa  99.4  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  36.09 
 
 
157 aa  97.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  30.6 
 
 
166 aa  97.8  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  34.97 
 
 
164 aa  95.5  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  33.13 
 
 
205 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  34.84 
 
 
172 aa  92  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  35.33 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  34.76 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  35.03 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  33.7 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  31.45 
 
 
150 aa  89.4  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  34.97 
 
 
180 aa  88.2  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  35.14 
 
 
197 aa  87.8  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  31.52 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  34.43 
 
 
193 aa  84.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  34.01 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  30.94 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  29.12 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  28.57 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  31.76 
 
 
180 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  28.8 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  27.6 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  27.6 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  27.6 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  27.6 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  27.6 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  28.07 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  27.6 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  27.6 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  27.6 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  27.6 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  27.47 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  27.53 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  28.57 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  25.95 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  28.81 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2698  carbonic anhydrase  32.8 
 
 
212 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  23.27 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  25.49 
 
 
291 aa  52  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  27.47 
 
 
180 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  27.47 
 
 
180 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1090  carbonic anhydrase  32 
 
 
198 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  27.47 
 
 
180 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  25.15 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  25.54 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  36.62 
 
 
246 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  33.68 
 
 
234 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  34.48 
 
 
256 aa  48.5  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  22.5 
 
 
229 aa  47.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  23.27 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2569  hypothetical protein  32.56 
 
 
246 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  23.88 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  29.25 
 
 
242 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  29.19 
 
 
245 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  35.62 
 
 
236 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2423  hypothetical protein  32.56 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>