90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6172 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  100 
 
 		 180 aa  359  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  86.59 
 
 		 184 aa  292  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  43.17 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  34.88 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  35.58 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  34.13 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  32.26 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  35.19 
 
 		 162 aa  85.1  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  34.57 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  36.05 
 
 		 141 aa  84.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  30 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  34.5 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  30.59 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  34.94 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  31.98 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  32.95 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  31.18 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  29.89 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  30.68 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  33.14 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  31.79 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  28.98 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  33.14 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  30.59 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  29.05 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  32.95 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  28.9 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  31.18 
 
 		 163 aa  72  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  30.59 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  30.59 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  29.38 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  30.59 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  32.52 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  30 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  27.95 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  28.07 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  33.11 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  27.27 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  32.21 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  33.09 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  28.74 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  27.42 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  32.54 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  30.41 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  29.52 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  26.79 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  23.76 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  27.56 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  27.03 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  32.65 
 
 		 213 aa  48.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  37.1 
 
 		 90 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  23.89 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  23.89 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  23.89 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  23.89 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  23.89 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  23.89 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  31.03 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  23.89 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  23.89 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  23.89 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  25.99 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6530  Carbonate dehydratase  25.26 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460093  normal  0.148465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  25.41 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  25.32 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  25.16 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05611  carbonic anhydrase Nce103, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11250)  27.01 
 
 		 212 aa  45.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0148146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  29.81 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  25.16 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  25.95 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  26.53 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5677  carbonate dehydratase  29 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  31.91 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  25.68 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  24.58 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  26.49 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2574  carbonate dehydratase  23.08 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  22.4 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  22.64 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000488965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  29.38 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01805  Carbonic anhydrase (EC 4.2.1.1)(Carbonate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCC5]  24.87 
 
 		 264 aa  42  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  25.13 
 
 		 209 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  29.87 
 
 		 150 aa  42  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  23.63 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  25.17 
 
 		 150 aa  41.6  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  24.16 
 
 		 214 aa  41.2  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  32.04 
 
 		 193 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0421  carbonate dehydratase  21.24 
 
 		 218 aa  40.8  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  32.04 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  27.78 
 
 		 210 aa  41.2  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>